利用hmmer进行二次搜索提取序列时，按照命令把E值设为0.1或者稍大一点1e-5，怎么出提示错误？如果把E值设为1e-10可以正常运行。 实际上我在做第一次搜索提取序列时也出现了错误，课件里的evalue值是1.2e-28，我在运行时也出...
...om.random((100, 100)), cmap=plt.cm.BuPu_r) # 生成100行，100列的，浮点数从0-1中随机。 # 参考链接https://www.cnblogs.com/DOMLX/p/9751471.html # camp(colormap)就不细讲了,可以看https://blog.csdn.net/lanchunhui/article/details/66972783 plt.subplot(212) #绘制一个两行一列...
我在网上搜索的关于 QTL-seq 的原理。为什么诱变得到的材料不能够用 QTL-seq 的方法来定位到基因？如果是 EMS 诱变材料且已自交 6 代，也不能采取 QTL-seq 的方法来定位到基因么？为什么？因为 Mutmap 方法需要野生型和突变型杂...
...l=rand(num); 解说随机数函数，返回0和整数num之间的一个浮点数。 Perl数学函数名 srand 调用语法srand(value); 解说初始化随机数生成器。保证每次调用rand真正随机。 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了...
...基因家族的hmm文件 该基因qlen大概500多，然后我第一次hmm搜索只得到了35个片段，而其中又有很多是同一个基因的不同部分匹配到了 hmm模型的部分，都是很小的一分部，请问老师这样的话是否需要做构建该物种特异的hmm模型，如...
...符型数据的字符dec 用来表示小数点的字符,指点小数点数row.names 保存着行名的向量活文件中的一个变量的序号或名字，缺省时行号为1，2，3，…col.names 指定列名的字符型向量，缺省值时为V1，V2,V3,…as.is 字...
你好，我做小麦基因家族分析时筛选得到的Terpene_synth_C_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt这个文件的基因是141个，运行下面的命令，得到的Terpene_synth_C_domain_new_out_removed_redundant.txt这个文件怎么是147个？谢谢老师 ！ manager@bl8vbox[ge...
...下面我就来总结8个最常用的转录组个性化分析技巧（部分配图来自19年新发表的转录组文章，文末附详细分析方法！） 1. 筛选功能基因信息 我们往往需要根据基因功能（例如化学感受相关，脂肪代谢相关等）从基因总表中筛...
同时跑物种注释和功能蛋白注释，用terminal4和terminal5，的分别同时跑，这可以吗？
...提示：BLAST Database error: Error: Not a valid version 4 database. 搜索百度要么下载版本4的数据库，要么 更新blast+ （https://blog.csdn.net/zhangjunya/article/details/108279859）。查看了一下课程所用镜像和数据库，无法操作啊（能力有限），还是...
...$3<1e-7{print $1,$2,$2,$3}' pvalue.txt |sort -k1,1 -k2,2n >pvalue.bed筛选关键的SNP时发现，生成的pvalue.bed文件不符合命令要求，我们是哦第一列、第二列、第二列、第四列，但生成的bed文件总是重复第四列，这个问题是出到哪里了呢？ pva...