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问题 请问基因表达模式折线图怎么画

从聚类到画图,应该用什么软件或者R包呢?另外太明白输入的是表达量还是foldchange?

问题 Perl SVG绘图怎么设置背景色

...$svg->circle(     cx => 20,     cy => 20,     r  => 15,     style => {         'fill'           => 'rgb(255, 0, 0)',         'stroke'         => 'blue',         'stroke-width'   =>  5,         'stroke-opacity' =>  1,     ...

问题 转录组测序数据量如何选择?

我想做个转录组实验,但是知道应该测多少合适,公司说有有4G、6G、8G之类的是啥意思?怎么衡量测的数据量够够呢?

问题 kaks计算过程问题

您好,我们采用了aln2axt.pl脚本运行,但运行得到的axt文件仍然equal,我们检查了我们序列的长度,序列比对总长度是3的整倍数.序列都含有起始密码子ATG,请问一下如何解决呢?

文章 duplicate_gene_classifier统计全基因组同类型复制事件的数目

...ifier属于MCScanX的核心程序,用于基因分类,统计全基因组同类型复制事件的数目。 命令行格式: $duplicate_gene_classifier Dl Dl是物种缩写。在运行duplicate_gene_classifier程序时需要去掉文件后缀名。 准备原始文件1:Dl.blast文件;...

问题 SSR引物设计

...这个脚本做其他序列都是没问题的,只有做这个序列设计出引物,是序列太大了吗?

问题 宏基因组基因定量salmon

老师您好,我在用salmon构建索引之后,对每个样本进行定量时显示支持RapMap类型的索引,请问该怎么解决?详见图片

文章 wget下文件失败,或者是空的解决办法

...2 url = 'http://ftp.luoo.net/radio/radio448/01.mp3' user_agent = 'Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64) AppleWebKit/537.22 (KHTML, like Gecko) Chrome/25.0.1364.172 Safari/537.22' headers = { 'User-Agent': user_agent, 'Referer': url } req = urllib2.Request(url, None, headers) response = urllib2.url...

问题 R语言中$符号和@符号取值区别?

想得到Vennerable绘制韦恩图,每一个交叉位置对应的ID信息,知道怎么取得?

问题 Cytoscape图片导出的问题

请问老师,我在软件中美化好的图片跟导出的图片相同应如何解决,1是软件中美化好的图片,2是导出的PDF图片  想要导出后的图片连线为直线 并且没有无效文字的显示

问题 基因家族分析时用大豆gff文件报错 killed

老师您好,我在进行大豆基因家族鉴定时,数据准备过程中想要进行“保留蛋白编码基因”出现报错“=> Version of the Bioperl GFF parser selected by AGAT: 3 gff3 reader error level1: No ID attribute found @ for the feature: 1    ena_assembly_gap        bi...

问题 使用xpclr分析出现TypeError: ufunc 'true_divide' not supported for the input types'

...组学大讲堂的网易云群体重测序课程在我们超算上搭建了分析环境(我是自行安装的各种软件,因为我们研究所规定能使用虚拟机)。在使用课程提供的黄瓜重测序数据进行xpclr分析的时候出现了这样的报错: 2022-06-24 16:17:2...

问题 宏基因组数据预处理问题

...者数据本质上区别大吧。因为我找到一篇论文他做mmvec分析时,用的宏基因组通路的对数转换后的丰度值与代谢组对数转换后的数据进行的,这和宏基因组物种分类的相对丰度值进行对数转换后与代谢组的对数转换进行Mmvec分...

文章 毕业答辩现场,导师扔了自己的论文怎么办?

...草率,毕竟作为老师,更多应该耐心教诲。 同时,也有少本校同学及网友表示:该老师认真负责,大学生已属于成人, 很多学生过于安逸,学习、作业能拖就拖,能抄就抄,挨到最后得已,胡乱一通, 多以,扔得好! ...

问题 bio-linux无法下

我是百度网盘的超级会员,下其他东西都没有问题,但是你们提供的bio-linux一直下动,求新的连接,谢谢!!!