做WGCNA时候发现这个警告,一脸懵逼,不知道错在哪里,请大神指点
老师,我的29个样本,聚类之后发现有四个样本不太乐观,如图所示,abline=2600去除了这四个样本,写文章的时候该怎么描述这里?标准是什么?图左边的Height代表什么?
用mega做的进化树,存储后上传至iTOL,为什么不显示bootstraps?请问怎么设置让其显示出来。谢谢!
你好,我用HMEER搜索基因家族的蛋白序列,筛选后进行系统发育树的构建时,有一些不属于任何一个家族,是我查找的序列有问题吗?谢谢老师 追加:我从NCBI CDD和Pfam上手动确认了结构域,都有保守结构域的。谢谢
你好,请问你去年9月15日问的关于基因与mRNA不对应(如下图)问题解决了吗?能不能指点一下呢?谢谢
老师,您好!我在WGCNA第二步,network construction中软阈值计算的过程中遇到了问题,暂时不知道如何解决,想请教下各位老师!!
具体报错信息如下: NOTICE: Running with system command <coding_change.pl ./indel_AT899.refGene.exonic_variant_function.orig /data/home/zhangzhi/genome-9-8//unknown_refGene.txt /data/home/zhangzhi/genome-9-8//unknown_refGeneMrna.fa -alltranscript -out ./indel_AT899.refGene.fa -newevf ....
老师,我在做泛基因家族成员存在缺失分析时,做统计各个样本家族成员数量,及根据数量对基因组进行排序时候,由于我原始得到的maize.WRKYgene.list文件里的基因名称,和ID.txt文件里的基因组名称无法链接,有很多基因组无法...
正在下载omicsclass/pop-evol-gwas,请问大家一般需要多久,我这个好久不动,在waiting,已经设置加速器了
老师我想知道我做比较基因组的韦恩图数据在哪个文件里,我想知道我做的物种里特有的基因家族但是我不知道在哪个文件里
在R语言中,有没有QQ-normal包或者函数能将表达量的值正态化?因为表达量的值大部分不符合正态分布。
老师,你好,请问计算中的r值是但双子叶不同,还是每个物种都不一样??谢谢
我在运行16.GeMoMa.sh,出现图1中的报错,我查看了database中gff文件,内容如图2,感觉不像是正常gff3文件的内容,图3是AI解答,是不是database中文件有错误?
...特殊字符,如下图所示: 需要检查蛋白序列文件,去掉不符合要求的序列。再次建库则不会报错。