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文章 一个好的“产品经理”该如何诞生?

...的一些经验,想分享给所有想做,或者在做产品的童鞋,要以为产品就只有高大上,敲黑板。细节决定成败,凡事只有脚踏实地,做好基本功,才能成功。  ![一个好的“产品经理”该如何诞生?](https://img-blog.csdnimg.cn/2020032...

问题 circos作图上染色体颜色的设置

...有大片段复制发生这么少的基因组吗?而且基因家族成员在这些大片段复制里。过它们有2对是串联重复就是了。 我的问题是,我做出来的circos图,第25-33号染色体,颜色都是黑色。这个如何设置呢?颜色一样,这样似乎...

文章 Hierarchical clustering主要聚类方法与R语言中聚类函数的应用

...业中,经常会利用到上述聚类方法,对生物数据进行聚类分析,例如R 中常见的相关聚类函数的应用:hclust()参数method: "single" 最短距离法"complete" 最长距离法"median" 中间距离法(=WPGMC)"average" 类平均法(=UPGMA)"centroid" ...

问题 叶绿体GetOrganelle组装成环,调整后还是

叶绿体GetOrganelle组装成环,按照植物叶绿体组装后,发现结果成环状,要怎样调整其成环呢 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)的方法调整后,还是出现问题: 1、GetOrganelle组装:增加轮数(-R选项),重新指定更近缘物种...

文章 iTOL查看进化树中节点ID

...要怎么使用呢? 其实很简单,进化树文件中的 node id 是需要生成的,iTOL在导入nwk文件时会为每个节点分配一个Node id。例如我用的nwk文件如下: 生成进化树后,可以查看每个节点都会有一个Node ID: 这样,我们就可以知道每...

文章 Trinity报错“Error, not recognizing read name formatting”

...时候,发现软件报错了: 该报错指出fastq文件的reads名称符合要求,于是查看了一下: 通过查询报错信息,认为可能是当前的reads名称让软件无法鉴别双端测序序列,于是做了如下的处理: 处理过之后的fastq文件: fastq2...

问题 如何对同一进化树分枝的叶节点进行上下位置的改变

如图,想请问如何把‘AT5G09740’放到‘TraesCS2D02G166900.1’上方呢,因为我发现美化进化树的时候,evolview里没办法对这个进行修改,但是修改的话同一个亚家族又会被分开,能画到一起。

文章 如何快速获取多条序列长度信息

...,第二列是序列长度,后三列是构建索引的信息一般你是需要的。

问题 异常样本mapping rate异常问题

...现DNA量极低,使用MDA方法扩增建库,BGI测序后做群体遗传分析。在snp-calling中发现比对率异常,具体如下。 [root@1d066d310974  23:24:26 /work/reseq_demo/3.map/result]# cat 268.map.stat.txt  129649865 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads) 129589994 + ...

问题 请问老师们,prism两组差异数值很小的数据怎么做折线图

知道我能否描述明白求助的问题,如下图所示,想要做的两组数据大概是0.0016和0.0012的区别,请问该怎样在prism的折线图上把两组数据分开呢

问题 请问老师在blastall的m8结果文件中,出现了重复的现象,是怎么回事?

一对参考基因和比对上的基因重复出现了好多次,而且后面的数字都一样,这是为什么呀?

文章 NCBI 下病毒基因组的gff3

...们提供了很多好用的小工具。病毒的基因组比较小,通常会像大型基因组那样释放的时候带有gff3和gtf文件,此时如果我们想获得病毒的gff可以在send to中选择保存文件的格式: 通过这个方式保存的gff格式如下: 其中第...

文章 以OKR驱动企业项目化管理变革

...楚要达到的目标,这样才能志向坚定,志向坚定才能镇定躁,镇定躁才能心安,心安才能思虑周祥,思虑周祥才能有所收获。 这既是做事的方法也是解决问题的思路。大至企业,小到一个几人的项目组,在开展工作之前...

文章 Scanpy数据结构:AnnData

...: 可以存储其他数据层,如归一化后的数据或差异表达分析的结果。uns(未排序的数据): 用于存储其他未排序的数据和元信息 AnnData object with n_obs × n_vars = 6050 × 32285 obs: 'in_tissue', 'array_row', 'array_col', 'gender', 'age', '...

文章 MNP标记设计中DP的计算方法

...1个窗口内有3个SNP。其中品种1与品种2有两个SNP的基因型同,记为1;品种1与品种3也有两个SNP的基因型同,记为1;品种2与品种3只有1个SNP的基因型同,计数。所以 t 的数量就是2。