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文章 R中的错误处理函数

...性,随着脚本逐渐复杂,一些较高级的错误处理函数就必可少了,我们今天来介绍几个R中的 1. tryCatch() 函数 功能: tryCatch() 函数是一种更复杂的错误处理机制。它仅可以捕获错误,还可以定义针对同类型错误的具体处理...

问题 想问一下大家做蛋白质谱搜库分析的时候用maxquant我原始文件是wife.scan格式的是raw格式的用此软件可以吗,因为看到在选项里面是有wiff的,但是我发现最后性能那里能得到结果,显示报错,想问有没有大神可以解答一下呀多谢多谢

问题 老师您好,群体结构分析自己的数据时,进行到文件格式转换那一步遇到了问题,报错写的是要将vcf文件正常排序,我自己在网上找到了相应的脚本,却能正常运行,报错写的是能生成JAVA虚拟机,我的脚本是是有什么问题呀,这个应该怎么解决呀

文章 人类免疫细胞marker基因

...是详尽的分类。细胞类型和Marker Gene 可能会因研究背景和分析流程而有所同。 免疫细胞亚型Marker Gene 示例CD4+ T Helper 细胞CD4、IL2RA、FOXP3(调节性T细胞,Treg)CD8+ 细胞毒性 T细胞CD8A、CD8B、GZMB(GZMH,Perforin)B细胞CD19、CD20、CD79...

问题 在进行二代测序数据的nt比对时出现了以下报错请问应该怎么解决

Warning: [blastn] Examining 5 or more matches is recommended BLAST Database error: No alias or index file found for nucleotide database [/home/yuanqing/shili/dir/nt] in search path [/home/yuanqing/shili/jia::]

问题 你好,请问你是做无参转录组基因家族分析吗?我想请问下,你做基因家族成员鉴定时,用的哪个文件,我看到那个课程里用的是蛋白质序列,但是我的转录本unigene里面是核苷酸序列,请问你是用什么文件做的基因家族成员鉴定呢?

无参转录组基因家族成员鉴定

问题 请问,在做WRKY基因家族分析提取结构域序列的时候perl script/domain_xulie.pl WRKY_hmm_out.txt Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa WRKY_domain.fa 1.2e-28;有必要提取第二个domain吗

问题 各位大佬好!我在筛选一批转录组数据里的差异基因时,当进行到构建dds对象的时候,r语言出现以下报错,说“一些值是整数”,当我上网查这个错误的时候,有人说是“数据已进行归一化,无法进行DESeq2分析”,请问各位大佬,还有什么解决方法嘛??谢谢谢谢

问题 R语言分析GEO数据,您好老师,19年参加培训的时候就是用的R3.6.1,自己运行出现如下报错

> boxplot(AffyBatch,col = cols,xaxt="n") Error in getCdfInfo(object) : Could not obtain CDF environment, problems encountered: Specified environment does not contain HuRSTA-2a520709 Library - package hursta2a520709cdf not installed Bioconductor - hursta2a520709cdf not available > options(Bi...

文章 linux命令详解之ls

...命令。ls命令的输出信息可以进行彩色加亮显示,以分区同类型的文件。 语法ls(选项)(参数)选项-a:显示所有档案及目录(ls内定将档案名或目录名称为“.”的视为影藏,会列出); -A:显示除影藏文件“.”和“..”...

文章 紧扣前沿热点--多种研究培训,总有你需要的!

...员处理数据的能力足之间的矛盾。所以,谁会生物信息分析,谁能处理基因数据谁就是课题组最靓的仔! 今年暑期(7月底开始)组学大讲堂为大家准备了丰富多样的线下和直播培训内容,早报名可享受早鸟价优惠! 学习...

问题 老师您好!用meme分析motif时,输入/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme ../WRKY_pep_confirmed.fa -protein -oc ./ -nostatus -time 18000 -maxsize 6000000 -mod anr -nmotifs 10 -minw 6 -maxw 100命令后显示zsh:no such file ordi

问题 基因重叠问题

老师,我在做基因家族分析的时候,发现鉴定出来的两个基因有重叠区域(重叠区域占了80%,两个基因的结构域也在这个重叠区域),并且去查看了基因组的注释信息,发现确实有重叠,当然这两个基因并是可变剪接类型。这...

问题 老师你好。16S和非靶代谢组学,因为组数太少,需要补充其余组的样本,可以直接补充吗

现在做完4个组   ,还需要再补充5个组 ,  就存在同批次的问题 ,   可以直接补充吗?

文章 好用的perl模块推荐

...>mkpath; 删除也同样有很多功能可以高效化你的脚本而需要每次都判断 # 删除空目录或文件,如果目录为空,这个方法将会失败。path("path/to/your/file.txt")->remove;# 删除一个非空目录及其内容path("path/to/your/directory")->remov...