问题 meme分析报错：Illegal character `U' in sequence LOC105388627. Change alphabet or fix data file.

请问老师，是根据最终得基因ID提取得蛋白质序列，为什么在做meme分析时，会出现这种错误？

问题 如何修改perl脚本从cds文件中提取上游序列呢？（有些cds中的scaffold可能不足1500）

... unless(@ARGV==3 ); use Math::BigFloat; use Bio::SeqIO; use Bio::Seq; $in = Bio::SeqIO -> new(-file => "$ARGV[0]",                                   -format => 'Fasta'); $out = Bio::SeqIO -> new(-file => ">$ARGV[2]",                            ...

问题 有参转录组分析第五步5.deg Error in newCountDataSet报错

...老师帮忙解答一下，万分感谢。  [ reached getOption("max.print") -- omitted 4 rows ] [1] "create DEG_list object is over" [1] "the number of origin gene is 27781" [1] "the number of gene (after filtering) is 17256" Error in newCountDataSet(countData = de$filterCounts, conditions = ...

问题 Orthofinder报错出现ZeroDivisionError: float division by zero

如题：python3.7 环境，Orthofinder最新版本，运行demo数据没问题 需要比对的序列长度不一，psi-blast比对是可以比上的。拿到这些数据单独再去比较就出现了报错。请问出现这个报错是不是说明没有找到 再用 MCL 聚类 得到 Orthogroups...

文章 从MEGA进化树分析结果nwk文件提取基因ID

...一脚本，可以实现此操作。 用法： perl nwk_geneid.pl  -i in.nwk  -o out.txt in.nwk 为输入的nwk文件，out.txt是输出的基因ID文件。 脚本代码； use Getopt::Long;use strict;my %opts;GetOptions(\%opts,"i=s","o=s","h");open(IN,"$opts{i}") || die "open $opts{i} faile...

文章 igraph 报错： libglpk.so.36: cannot open shared object file: No such file or directory

** demo ** inst ** byte-compile and prepare package for lazy loading ^A** help *** installing help indices *** copying figures ** building package indices ** installing vignettes ** testing if installed package can be loaded from temporary location Error: package or namespace load failed fo...

问题 Linux服务器上，运行提取结构域的脚本的时候，出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误，请问如何解决

这样的在服务器上在安装biolinux吗

问题 请问老师，使用annovar进行注释出现报错，如下：Error: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

...，这一次添加完报错信息是：在输出文件时无法识别格式invalid record found in annovar outputfile:。是不是软件没有更新？annovar/2019Oct24/annotate_variation.pl 我用的是这一版。还是说有一些低质量没有过滤的snp导致了识别错误，我上一步的...

问题 R语言GAPIT跑GWAS错误 Error in ‘[.data.frame‘(GD,,!is.na(GI.MP[,3])):选择了未定义的列

问题 MCscan运行问题：ZeroDivisionError: float division by zero

... Traceback (most recent call last):  File "/usr/lib/python2.7/runpy.py", line 174, in _run_module_as_main    "__main__", fname, loader, pkg_name)  File "/usr/lib/python2.7/runpy.py", line 72, in _run_code    exec code in run_globals  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/jcvi/graphic...

问题 基因家族分析文章：筛选时为什么选用基因组数据库的编码蛋白，而不是蛋白组数据库？

...thors should underline that their results report the finding of candidate genes encoding protein and not candidate proteins, as they performed a genome wide research and not a proteome research and protein identification.请问，我该如何回答啊？

问题 xpclr报错AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'keys'

...我的命令：xpclr --out /hpc/home/t2024096/FST/out --format vcf --input /hpc/home/t2024096/data/cxx.vcf.gz --samplesA /txtlist/nong.txt --samplesB /txtlist/19.txt --size 200000 --step 100000 --chr chr1A出现以下报错 2025-02-18 17:34:41 : INFO : running xpclr v1.1.2 2025-02-...

文章 教你如何使用u盘安装Linux系统

... users. CentOS-7-x86_64-NetInstall-2009.iso This is the network install and rescue image. The installer will ask from where it should fetch the packages to be installed. This image is most useful if you have a local mirror of CentOS packages. CentOS-7-x86_64-Everything-2009.iso This imag...

问题 win10 中docker 下载镜像报错：no matching manifest for windows/amd64 10.0.18362 in the manifest list entries

问题 老师您好!我在用samtools获取染色体长度是出错，它报了一个different line length in sequence ……segmentation default 请问这个怎么解决啊