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文章 MA plot 绘图计算公式

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...

文章 affy包查看全匹配探针与错配探针

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文章 ggplot2不同几何对象所能对应的图形属性

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文章 箱线图与分面--ggplot2

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问题 关于使用nohup vcftools过滤vcf文件的问题

...讲堂GWAS分析课程中的示例数据rice.raw.vcf.gz，并使用vcftools软件进行过滤，并试验了使用nohup和不使用nohup后得到的文件结果比较，使用nohup得到的vcf文件结果有异常不能进行后续分析，具体如下： 1）不使用nohup时的代码 vcftools --...

文章 写论文崩溃？常委会委员建议：取消本科生、研究生发表论文的规定

...价值。 二、不该取消阵营 这部分人表示：不发论文，怎么体现研究生的“身份”?起码它可以证明你有始有终。 A：硕士研究生，一篇文章都发表不了，还能叫研究生?改名吧! B：研究生包括硕士和博士，博士排除在外，只看...

文章 基于R实现统计中的检验方法---T检验

...性检验.一般认为是要求残差的方差齐，所以一般的统计软件都做的是leveneTest#结果说明两独立样本数据方差齐性，可以进行独立样本T检验。t.test(High,Low,paired=FALSE)        Welch Two Sample t-testdata:  High and Lowt = 1.9319, df = ...

文章 R语言如何绘制MA图

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文章 R语言基础入门—数据结构（1）

...阵创建 R 语言的矩阵可以使用 matrix() 函数来创建，语法格式如下： matrix(data = NA, nrow = 1, ncol = 1, byrow = FALSE,dimnames = NULL) 参数说明： data 向量，矩阵的数据nrow 行数ncol 列数byrow 逻辑值，为 FALSE 按列排列，为 TRUE ...

文章 高质量黑麦基因组组装揭示重要农艺性状基因

...探究基因复制事件对黑麦基因组的影响，作者使用MCScanX软件分析了黑麦重复基因的组成。从a图和b图中可以看到，黑麦中的近端重复基因（PDGs）、串联重复基因（TDGs）和转坐重复基因(TrDGs)数量显著高于其他一些禾本科物种。随...

文章 对组装结果中GAP左右批量设计引物

...od/readme.txt" or die "$!";my $readme=<<"README";建议使用editplus打开本文件；*primers.result.xls#SEQUENCE_ID-- 引物ID （命名规则：GAP所在来源序列_GAP所在位置start_GAP所在位置end_GAP长度_备用引物编号 ; ）PRIMER_LEFT_SEQUENCE-- 左引物PRIMER_RIGHT_SEQUE...

文章 WGCNA 中Relationship between module eigengenes图片绘制--plotMEpairs函数

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文章 ggplot2主题theme参数

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文章 小麦MADS-box基因家族文章 new phytologist（7分）

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文章 MutMap+和mutmap分析差异（BSA）

...问题：SNP位点一般为两个等位基因，与参考基因组比较我怎么知道哪个碱基是突变的？ 答：作者利用重测序的方法，对野生型品种（Hitomebore）进行重测序，将read比对到参考基因组日本晴（Nipponbare ）上，将Hitomebore和Nipponbare ...