找到约 15 条结果

文章 蛋白结构预测

...自动进行预测并返回预测的蛋白质结构。此外,I-TASSER还可以提供蛋白质功能预测,如结合位点、酶活性位点等。 4. 优点: 适用于没有已知模板结构的蛋白质,这使得I-TASSER特别适用于那些传统模板匹配方法无法预测的蛋白质。...

文章 一个自动获取最新文献的方法!

...方向相关的文献,尤其是最新文献。那么有没有什么方法可以自动获取最新文献呢?这里,小编给大家介绍NCBI上的一个自动获取文献的方法。 众所周知,NCBI的一个重要功能就是PubMed文献搜索,对该功能加以设置即可定期自动...

文章 使用compare_means()t.test进行显著性检验时报错

...至少有两个观测值: 将不合格的数据从数据框中清除可以正常分析。

文章 PCAI型标尺与II型标尺

...以及变量-变量之间关系的描述,由于没有任何一种方法可以在同一个双序图中同时展示对象和变量的关系,因此存在两种标尺(scaling)选择。 如果主要目的是解释对象之间的关系,则可将PCA排序图执行I型缩放,即I型标尺(sca...

文章 gnuplot安装

... 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂...

文章 openssl 安装

... -y remove openssl-1.1.1g-15.el8_3.x86_64 代码语言:javascript复制#可以去该地址下载自己想要的版本的OpenSSl https://www.openssl.org/source/old/1.0.2/openssl-1.0.2u.tar.gz 代码语言:javascript复制#解压 tar -zxvf openssl-1.0.2u.tar.gz 代码语言:javascript复制#...

问题 Tassel进行自己的GWAS分析中,自动分析pca时,不生成pca1~3文件(使用的是服务器)

执行以下命令,可以显示以上结果,应该是运行过程没有问题。但是实际上并不生成任何文件。 run_pipeline.pl -Xmx30G -fork1 -h hapmap.ordered.hmp.txt \     -PrincipalComponentsPlugin  -ncomponents 3  -covariance true -endPlugin \     -export pca -runfork1...

文章 group_by()和any()连用判断每个分组中的元素是否满足特定条件

... 1, 0, 0)) 如果我们想要判断每个分组中是否存在元素>0,可以使用group_by()先对数据进行分组,然后使用filter函数结合any函数来判断每个分组是否满足特定条件并进行过滤。 #加载包library(dplyr)# 使用group_by和any函数来判断每个group...

文章 转录组分析基因注释常用的数据库

1 、Nr:NCBI非冗余蛋白数据库,包含的信息很全面, 注释的基因较多。 2、COG :中文释义即“同源蛋白簇”。COG 分为两类,一类是原核生物的,另一类是真核生物。原核生物的一般称为 COG 数据库;真核生物的一般称为 KOG 数...

文章 R语言apply批量进行t.test

...每一行依次进行t.test,如果写成循环,运算速度非常慢,可以利用apply()函数辅助完成计算过程。 譬如有如下数据,共2000行6列,对A组数据和B组数据进行t.test计算: > head(data,2)                        A1   A2  ...

问题 Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

请问您这个谷值问题怎么解决的

问题 微生物多样性分析课程镜像ampliseq-q2运行出错:there is no package called ‘BiocManager’

...st -> library Execution halted 问题: 是不是缺少BiocManager这个包?是镜像ampliseq-q2中缺乏呢,还是系统本身缺少,该如何解决,谢谢!

问题 根据覆盖度及比对率如何剔除样品、gatk VariantFiltration过滤

...raw.gatk.vcf.gz文件 我的服务器是500G的,--java-options "-Xmx80g"可以再改大一点吗?我看别的问答下面说是内存不太能加快进程,只能一直等吗?我就是害怕等一个月搞不定 此外,我还测了5个同属不同种的样品准备用于群体遗传的...

文章 RNA测序阐释大豆产量调控网络和关键基因

...阶段取样。 2.收集并处理S1时期的种子,使用显微镜观察这个时期两种大豆种子的特征。 3.提取全部RNA,利用Illumina HiSeq2000测序。 4、差异基因和转录表达分析、主成分分析、加权基因共表达网络分析。 研究结果: 1.形态分析 ...

文章 RNA测序阐释大豆产量调控网络和关键基因

...阶段取样。 2.收集并处理S1时期的种子,使用显微镜观察这个时期两种大豆种子的特征。 3.提取全部RNA,利用Illumina HiSeq2000测序。 4、差异基因和转录表达分析、主成分分析、加权基因共表达网络分析。 研究结果: 1.形态分析 ...