找到约 15 条结果

文章 rockes7 共享目录设置

...降低权限。no_all_squash(默认)  访问用户先与本机用户匹配匹配失败后再映射为匿名用户或用户组。all_squash  客户端的使用者用户统一被转换成匿名用户nfsnobody。subtree_check (默认)  若输出目录是一个子目录,则nfs服务器...

文章 R语言用tidyr包进行长宽数据转换

...包是reshape或reshape2,而tidyr包可以看作是reshape2包的进化版本,该包的作者依旧是Rstudio的首席科学家,R语言界的大神Hadley Wickham。tidyr包往往与dplyr包结合使用,目前渐有取代reshape2包之势, 是值得关注的一个R包。接下来我们用例...

文章 TCGA数据库中临床样品编号详解(Barcode)

...据挖掘生物信息文章(宫颈癌)GEO数据挖掘直肠KM-plotter在线做生存分析GEO数据如何挖掘?案例解析!免费领取生信课程(适合小白自学生信)《Linux生信分析环境搭建Bio-linux》细述ceRNA网络研究思路TCGA数据挖掘文章-分析ceRNA的“...

问题 老师,您好!我找到MEME分析perl脚本,请求帮助!

老师您好! 我在使用Bio-Linux-8.07版本(官网下)进行基因家族分析,在MEME分析motif这一步,我的Bio-Linux系统中没有进行这一步的perl脚本,基因家族分析课程的参考资料中也没有提供改脚本。 希望老师能给予帮助,谢谢! 祝...

文章 分分钟教你绘制基因结构图!GSDS

今天介绍一款在线绘制基因结构的工具Gene Structure Dispaly Server,简单好用功能还挺强大。运用它能够绘制清晰的基因结构,清晰明了地展示外显子、内含子及UTR的位置。还可以联合其他数据绘制进化树-基因结构图,展现基因结构...

问题 老师您好!我在做基因家族成员鉴定时发觉,我的目标物种有多个版本的基因组数据,我需要如何选择用哪一版本

问题 如何查询hmmer 版本

我安装完虚拟机之后,hmmer,meme等的版本应该怎么查呢?

文章 AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'color'

python 版本的mcscan分析最后绘制共线性绘图时报错如下: 运行命令如下: /biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.graphics.karyotype  --format=pdf  --figsize=15x5 mcscan_seqid mcscan_layout 报错信息如下: ms.boundary', 'scipy.spatial.kdtree']12:29:39 [__in...

文章 python版本xpclr报错

...b/python3.12/site-packages/xpclr/methods.py 报错原因:scipy高于1.14版本的话romberg函数被删除 https://docs.scipy.org.cn/doc/scipy-1.14.0/reference/generated/scipy.integrate.romberg.html 可以看一下自己的版本: pip show scipy 解决办法: 降低scipy版本: conda ...

问题 你好,我也有数据处理的问题,请问数据是如何处理的呀?谢谢谢谢谢谢

老师,请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图,我上传了两个文件,第一个文件是图一,第二个文件是图二,我想用OTU的ID号做分析相,想做门水平的细菌,第二个表是抗性基因的数据,想观察抗性基因和门水平菌的...

问题 老师,我在做基因家族相关分析时,发现NCBI已上传的基因组注释全,规范,其它网站也没有收录,基因家族分析能通过转录组数据(无参有参数据都有)来分析

文章 使用Copilot自动在Rstudio中写代码

Github Copilot 是一个基于 OpenAI 的 GPT-3 技术的 RStudio 插件,帮助 R 语言开发者更快速、更高效地编写代码。这个插件可以根据你的输入提供智能的代码建议、自动补全和文档提示,从而加速编程过程并提高代码质量。通过结合...

问题 老师,想请教一下TCGA基因表达数据的问题,我从xena.ucsc网页上下了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv;然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ,没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换,却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID,想问下老师,这种情况该怎么处理?同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个?

文章 叶绿体基因做跨物种系统发育分析

...要意义。今天小编就来介绍如何用叶绿体基因做系统发育分析。 于已测序的物种,我们可以直接下基因组数据;而没有测序的物种就需要转录组分析数据了。通常是多个物种一起进行分析的。以转录组数据为例,其步骤如下...

问题 请问您使用heatmapper时有遇到第六列缺失的情况吗

在线网站http://www.heatmapper.ca/expression/作图时,总是缺少一列显示在热图上,想请问您知知道