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问题 老师,在看您教学视在线数据库CDD,SMART,PFAM手动确定结构域时,想问问怎筛选目的结构域?保守结构域结果怎么解读,SMART中我批量输入会出错,但是一条一条输入就会这个要怎么办?

文章 基因家族鉴定分析操作手册:

...https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121407 绘制热图在线工具:http://www.heatmapper.ca/    使用笔记:https://www.omicsclass.com/article/792 meV工具绘制热图:http://www.omicsclass.com/article/263   ;修改颜色:http://www.omicsclass.com/article/437 ...

问题 老师,报名参加基因家族学习只有docker版本的吗,安装一直提示错误,有没有biolinux版本的?

问题 老师您好,挂文件夹失败,这种情况是什么导致的呀,开始我下了最新版本的,出现这种情况以后查了一下说可能是版本问题,我又换了6.0.4和6.0.0版本的,也是一样的情况。。

文章 腾讯敏捷之道,实施敏捷开发,看我就够了

...越来越高,为了满足用户的需求, 人家一个星期发一个版本,我们仨月才能憋出一个来 , 那还被打的满地找牙?   问题是如何才能反应迅速?  我们先来看一个场景:   一、残酷的现实 软件开发有一大难题就是客户脑...

问题 biolinux虚拟机一直黑屏,尝试在设置—常规—版本中修改,找到64位的版本

1、biolinux虚拟机一直黑屏 2、看社区问答里说要把操作系统对应64位,但是我这里没有64的,一直按教程里的安装的,磁盘空间也还足够 请问这要怎么解决?

问题 如何筛选阈值来作为潜在的成员来做第二次的hmm筛选

...到了35个片段,而其中又有很多是同一个基因的同部分匹配到了 hmm模型的部分,都是很小的一分部,请问老师这样的话是否需要做构建该物种特异的hmm模型,如果想做的话,因为本身得到的数量较少,是是该把所有匹配得到...

文章 eclipse 老版本地址

eclipse 版本发布历史版本:https://www.eclipse.org/downloads/packages/release JDK8可以使用: https://www.eclipse.org/downloads/packages/release/oxygen/3a

文章 哪种生物信息学习方式最适合你?

... 点评:大热的直播也给教育行业带来了新的生机,老师在线讲课,能够及时的解决学习过程中遇到的问题,同时课时之间有间隔,可以给出充分的练习时间,这点甚至是线下培训也没有的。此外几十个人一起在直播间里的这种...

文章 NCBI上传高通量测序数据到SRA数据库 aspera 支持续传

... 在 windows当中安装与使用: 1.安装 下对应windows的版本:https://downloads.asperasoft.com/en/downloads/62 aspera-cli-x.x.x.xxx.xxxxxxx-win-xxxx-32-release.zip 然后解压 然后将解压的路径下的:C:\aspera-cli-3.7.7.608.927cce8-win-v140_xp-32-release\cli\bin  目...

问题 老师你好,我在使用qiime进行聚类分析中的pick_open_reference_otus.py进行聚类时,总是提示usearch61的版本对,后来使用psortmerna_sumaclust 分析到一半的时候也开始报错了

具体报错的信息如下 Traceback (most recent call last):   File "/biosoft/miniconda/envs/qiime1/bin/pick_open_reference_otus.py", line 453, in <module>     main()   File "/biosoft/miniconda/envs/qiime1/bin/pick_open_reference_otus.py", line 432, in main     minimum_failure_thr...

问题 关于用Perl脚本进行同源基因正选择分析

老师您好,想问一下我用paml软件包和perl脚本进行正选择分析,用conda安装paml和bioperl时都附带安装了一个版本的perl,导致运行脚本时常常报无法找到对应模块的错,怎么才能解决呢

文章 blastall 搜索比对输出结果 m8或者m9格式说明(blast+ m6格式)

...情况我们看第3、11、12两列,e值越小越可靠。 blastall 老版本对应的参数是 -m 8 blast+对应的参数是-outfmt 6 更多生物信息课程:1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因...

文章 blast序列比对中E值是什么意思?

E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this score and homology by chance (from random sequence), that is, the low...

文章 qRT-PCR相对定量计算详解 qPCR

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