...其中关键的就是差异基因，以及差异基因的功能富集。这个结果是最详细的，应该结合表型，多分析。如果这个结果没有研究清楚，请不要在去研究可变剪切，lncRNA等分析结果。 先写这些，点到为止，我将持续更新此文。
...删除左边字符，保留右边字符，注：从左边开始删除第一个指定符号及左边的所有字符 代码: echo ${var#*//} 其中 var 是变量名，# 号是运算符，*// 表示从左边开始删除第一个 // 号及左边的所有字符 即删除 http:// 截取结果是 ww...
....counts.tsv.gz done #合并人的所有的counts数据,awk只输出第一个文件的表头 zcat *.counts.tsv.gz |awk -F"\t" 'NR==1 || $1!~ /barcode/ {print $0}' |gzip - > all_human_counts.tsv.gz 单细胞分析 这个数据有点特殊为indrop的单细胞数据, 也是测的3’端，因...
绘制饼图的过程中，利用ggplot2的geom_bar结合coord_polar实现，需要理解的点是饼图的排布是按照aes(fill）的因子顺序确定的。譬如数据如下 > dat type Num1 A 902 B 343 C 564 D 995 E 15 必须根据...
想咨询一下，想注释出来那些样本，使用附赠的课程里的3个月的服务器，能不能带的动？谢谢
... 1.安装软件下载地址主页：MCScanX MCScanX源码地址，把这个文件下载下来：http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/MCScanX.zip 下面的代码，可在我们的biolinux系统上直接执行，创建目录及下载： cd /biosoftsudo wget http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/MCScanX...
# 对基因组构建HISAT indexecho "Step1: build reference index "hisat2_extract_splice_sites.py /bioData/run_data/lixp/work/GZ_yangtao2/refs/Yangtao2.coding.gene.V1.0.20190227.gtf > /bioData/run_data/lixp/work/GZ_yangtao2/refs/splicesites.tsvhisat2_extract_exons.py /bioData/run_data/lixp/work/G...
...组，搜索我所研究的昆虫也几乎没有什么基因，但是同一个目 的昆虫有比较深入的研究了。这是前提。正在着手测基因组，但前期测了一个无参的转录组，从中挑选并得到一段序列，公司标注这是cds区的序列1、我可以利用这段...
老师，请教您一个关于RNAseq数据分析的问题，如果我有1个对照组、3-5个实验组（每个实验组有两个重复），我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗？可以用什么方法呢？ 我目前只接触过两组间（1个对照组、1个实验组...
...因的鉴定 作者通过blast方法，在冬枣基因组中共鉴定到30个扩展蛋白家族基因，如下图：共划分为4个亚群：19个ZjEXPAs、 3个ZjEXPBs、1个ZjEXLA和 7个ZjEXLBs。 绘制家族内基因染色体位置分布图，如下图：其中一个ZjEXPA19位于scaffold上...