找到约 15 条结果

问题 老师,我需要用cufflinks Linux x86_64 binary做表达分析,根据课程安装了虚拟机导入的linux系统

...cufflinks Linux x86_64 binary。想问一下在虚拟机的Linux系统下怎么安装cufflinks Linux x86_64 binary,以及有没有cufflinks Linux x86_64 binary安装包以及操作指导。

文章 linux行列互换

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

文章 小尺度的种群历史分析——∂a∂i原理解析

1.频谱生成 ∂a∂i是一个强大的软件工具,用于模拟多个群体间遗传变异的联合频谱,并将其用于群体遗传推断,而频谱文件可以从VCF文件中获得。 在种群分化之前存在的基因型是祖先基因型(ancestral),而在分化后突变产生...

问题 用 hisat2 建索引时出现 “is not reverse-deterministic, so reverse-determinize...”

...图所示: 最后系统自动kill掉了建索引的进程,请问这该怎么解决?谢谢!

文章 命令行 光标移动技巧

...移动光标而使用较远的方向键,更不会使用鼠标,那这是怎么做到的呢,我们来简单介绍一下 基础移动光标 Ctrl – a :移到行首Ctrl – e :移到行尾Ctrl – b :往回(左)移动一个字符Ctrl – f :往后(右)移动一个字符Alt – b :...

问题 老师您好,我想分析样本的甲基化数据,但是TCGA里的脑肿瘤只有肿瘤样本,我能从GEO中下载健康样本的甲基化450的数据,可以吗?

可以将两者的数据直接按照甲基化探针直接merge嘛,批次效应怎么处理?

文章 ENA数据库查询SRA数据

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

问题 用TBtools做基因结构,使用他人电脑同样的数据能做出来,但我的电脑就是做不出来

...能做出来,但我的电脑就是做不出来。请问各位老师应该怎么解决 7月 20, 2022 5:28:57 下午 biocjava.GUIexcutors.JIGplotToolkit.AmazingGeneViewGUIPanel$19$1 run 严重: null java.lang.NullPointerException: Cannot invoke "java.util.ArrayList.iterator()" because "SeqDomainI...

问题 https://snp-seek.irri.org/_download.zul从这个网站下载全基因组测序文件,进行GWAS分析,下载哪几个啊

愁死了,手里有从这个基因库的一些品种,想把这个基因库的全基因组序列下载下来,可是不知道怎么

问题 Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误,请问如何解决

Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误,请问如何解决,这个问题之前有提过,但是没有人回答,有人只是指出可以安装docker,但是需要root用户安装,没有root权限的用户怎么

文章 awk匹配字符串

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

文章 blast+命令选择

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

文章 IF=4.8|对4种天南星科植物基因组进行WRKY基因家族分析,并分析其在魔芋中的表达

...算了成员的理化性质,使用在线工具WolF PSORT预测基因在细胞中的表达位置。 之后使用TBtools对基因在染色体上的位置进行可视化展示: 2. 系统发育分析探究家族成员在四种植物中的进化关系 作者选择4种植物与拟南芥和水...

问题 老师,请教您一个关于RNAseq数据分析的问题,如果我有1个对照组、3-5个实验组(每个实验组有两个重复),我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗?可以用什么方法呢? 我目前只接触过两组间(1个对照组、1个实验组)基因表达数据的差异分析,未接触过多个实验组数据的分析,所以想请教下老师,希望得到您的帮助,先谢谢您啦!

请问多个处理组分别和对照组比对,比如处理组1和对照组比对,在命令中是怎么输入啊?老师,教程上是一个处理组一个对照组,-r指定对照组就行,但是如果还要指定对照组,怎么输入呢?谢谢!

问题 想请教一下,stringtie定量后,得到一个基因对应多个转录本,那么它的定量结果,即FPKM值应该如何取舍?

....713859";您好,我的大部分基因都是一对多的情况,具体该怎么解决,谢谢!