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请问老师 我现在已经分析完基因家族和其花的转录组FPKM,现在需要加荧光定量,这个荧光定量是根据转录组进行的吗?具体要怎么样进行,我文章是聚焦花进行写的,是不是只用采花进行荧光定量分析?
...y blocks ATH_rapa.bed blocks.layout --glyphstyle=arrow时就出问题了,怎么也算不出来,要是layout文件有问题,那么下面这个微共线性分析就不会运算出来,直线我也尝试了,没问题可以运行出来,就是到了arrow和着色就不行了,想问一下,...
NCBI中只有fna.和gbff,其他的网址没有这个物种,真的不知道怎么做了,球球各位老师帮帮忙。
...对上基因组的多条染色体的多段序列,请问这种情况应该怎么取舍呢?提取比对结果最好的还是都提取出来最后比对完再删除呢?还有个问题就是genewise比对以后需要手动去找起始、终止密码子吗?我看文章里有的没找,但是有...
...gtf文件是由gff生成,是因为gtf文件里缺失gene_id吗?那该怎么整理补齐呢?请老师指点,谢谢老师~ 报错如下: gff文件如下: 用gff文件自动生成的gtf文件如下: 请老师指点!
下图是我登录的命令: 下图是登录到rstudio中的界面:没有与我的文件夹关联起来,这是怎么回事啊。
我用命令过滤后vcftools --gzvcf china-wild-ibex-clean.vcf.gz --max-missing 1.0 --recode --stdout | gzip -c > china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz 在去建立索引tabix -p china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz 这个文件出现下面的错误是怎么回事?
...ffold,最长的是1267525bp,最短的是1900bp,共66条,请问这里该怎么解决呢?
blast format: 5 = BLAST XML, 格式 相比于 6 格式 包含更多的信息内容,包括比对的序列信息,长度信息等等;接下来我们可以用bioperl包来解析,获取自己想要的信息; #!/usr/bin/perluse strict;use Bio::SearchIO;use Data::Dumper;my $fi ...
...s值数据都是整数,如果我只想用limma包的话,老师我需要怎么处理一下呢?是log()一下,然后用scale() 吗?麻烦老师了!
各位老师好,我在学习基因组重测序数据分析实战,运行index.sh时,显示没有找到retrieve_seq_from_fasta.pl 这个代码,我去scripts里面找,确实也没有这个retrieve_seq_from_fasta.pl ,怎么办啊?