文章 Molecular Plant | 一个接近完整的拟南芥基因组组装

...生物学的研究。20多年后，拟南芥基因组TAIR10仍然存在165个缺口，但随着技术的发展，大家致力于实现没有gap的、端粒到端粒的基因组组装，因此拟南芥的基因组也进行了更新。目前已经发表的高完整度拟南芥基因组有XJTU和CEN，...

文章 Linux sort命令使用-g对科学记数法/e记法进行排序

...的值进行排序，而且默认是从小到大排序，如果你是查看p值从小到大的排序，那么都不需要添加-r参数就可以拿到结果，快捷方便。 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1. 文章越来越难发？是...

文章 快速查找电脑中目标文件的方法

​老师：小王，你把A、B、C三个样品差异基因的维恩图给我发一下。 小王：好的，马上！ 十分钟后，小王：转录组的结果太多了，得花点时间，您等下！ 大海捞针是个技术活 在各家测序公司的努力下，现如今转录组的分...

文章 HISAT2比对时报错|(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL)

我有12个样本在进行HISAT2比对时有3个样本出现报错(ERR): hisat2-align died with signal 9 (KILL) 运行脚本： hisat2 -p 10 --rg-id=L2 --rg SM:L2 --rg LB:L2 --rg PL:ILLUMINA -x iwgsc_refseqv2.1_assembly --dta -1 L2_1.clean.fq.gz -2 L2_2.clean.fq.gz 2> L2.summary 运行一段...

问题 服务器超过5个线程，被killed。请问怎么使用名单规定线程？下面命令如何修改规定线程。

docker run --rm -v /home/us180/gene-family:/work -it omicsclass/gene-family:v2.0

问题 请问可以同时运行2个terminal吗，在内存和存储还有cpu都有剩余很多的情况下

同时跑物种注释和功能蛋白注释，用terminal4和terminal5，的分别同时跑，这可以吗？

问题 老师，请问用megaX做进化树分析时，序列有22个，但是它老是弹出这个页面是怎么回事呢？

问题 GSDS网站最近老是打不开，信号是好的，而且试过五六个不同的电脑，网站是在维修吗？

问题 有几个不同品种的文件夹怎么进行基因鉴定？是单独鉴定还是合并呢？合并是要怎么合呢？

问题 想问一下怎么查NCBI现在已经收录了多少个叶绿体基因组和线粒体基因组

问题 老师 就是我做到cafe进化树这里 就是做出来k=2 3 4 5这几个结果文件是空的

问题 WGCNA分析内存的问题

前段时间对80个样品，20000个基因进行WGCNA分析，可以顺利分析；最近对34个样品，14000个基因进行分析时，在计算TOM值时总出现“cannot allocate vector of size 1.6GB.”这是为什么呢？样品数和基因数变少却无法计算。（实验室服务器64...

文章 R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程

...a.frame(x = c(1:100))df$y<- 2 + 3 * df$x + rnorm(100, sd = 40)head(df)ggplot2基本的散点图并添加拟合曲线library(ggplot2)p<- ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_smooth(method= "lm", se=FALSE,  color="black", formula = y ~ x) + geom_point()p如果要显示95%...

文章 4个样品重测序发PlosOne

...，可以。今天小编就来分享一篇小投入高产出的文献；4个甜瓜重测序绘制抗白粉变异图谱[1]发PLoS ONE； 文献解读 作者对白粉病不同抗性的4个甜瓜品种进行高深度重测序，四个品种中三个高抗白粉病（ Edisto, MR-1, and PMR5: resis...

文章 GEO数据挖掘生物信息文章解读（直肠癌）

...些，但是对于生信数据挖掘刚刚入门的生物汪来说却是一个非常好的入门级别的文章。 文章的目的是通过生物信息分析的方法，挖掘GEO和TCGA数据库当中的公开数据，从而发现与直肠癌预后相关的biomarker，为直肠癌的诊断和治疗...