问题 WGCNA分析内存的问题

前段时间对80个样品，20000个基因进行WGCNA分析，可以顺利分析；最近对34个样品，14000个基因进行分析时，在计算TOM值时总出现“cannot allocate vector of size 1.6GB.”这是为什么呢？样品数和基因数变少却无法计算。（实验室服务器64...

文章 R语言ggplot2散点图添加拟合曲线和回归方程

...a.frame(x = c(1:100))df$y<- 2 + 3 * df$x + rnorm(100, sd = 40)head(df)ggplot2基本的散点图并添加拟合曲线library(ggplot2)p<- ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_smooth(method= "lm", se=FALSE,  color="black", formula = y ~ x) + geom_point()p如果要显示95%...

问题 ANNOVAR变异注释报错：Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

...upsWithoutExons 不知道是不是这里的问题影响了后边？ 这个问题我在Github上查了一下，有个人提问作者，和我的问题是一样的 作者给出的回答是手动改掉有问题的那三行，给后边加个基因名字？不知道是改哪个文件，我在snp.r...

文章 4个样品重测序发PlosOne

...，可以。今天小编就来分享一篇小投入高产出的文献；4个甜瓜重测序绘制抗白粉变异图谱[1]发PLoS ONE； 文献解读 作者对白粉病不同抗性的4个甜瓜品种进行高深度重测序，四个品种中三个高抗白粉病（ Edisto, MR-1, and PMR5: resis...

问题 使用gapit的五个模型Blink、GLM、MLM、MLMM、FarmCPU，跑出来的结果几乎一致，这是什么原因呢

问题 图1是用命令查询了，图2就是遇到的问题，文件始终显示无法启动传输，但有几个已经传输成功了

问题 老师，我的结构变异文件是5个梨品种，转录组数据中与sv相同的品系，只有3个，这个影响吗？

文章 GEO数据挖掘生物信息文章解读（直肠癌）

...些，但是对于生信数据挖掘刚刚入门的生物汪来说却是一个非常好的入门级别的文章。 文章的目的是通过生物信息分析的方法，挖掘GEO和TCGA数据库当中的公开数据，从而发现与直肠癌预后相关的biomarker，为直肠癌的诊断和治疗...

问题 各位老师，请教个问题，二代测序获得的病毒数据库中存在部分细菌序列污染，请问这个细菌污染序列怎么去除比较好？

问题 老师 您好 我在做WGCNA的时候 做出可视化热图是反的 有好几个同学都是这样 请问是怎么解决

问题 sge投递任务，大约252000个job id后，投递任务状态一直是qw，不r了，这个可能什么原因呢

问题 在基因家族分析中的顺势作用元件分析中有几个差不多的元件是不是一个元件

请问这三个元件是不是都是ABRE元件啊，还是三种不一样的元件

文章 已知目标基因，如何进行局部共线性绘图？

... agronomically important genes”，在这篇文章中，作者构建了一个高质量的威宁黑麦基因组，并对黑麦优良性状的遗传和分子基础进行了解析。 作者关注的黑麦种子贮藏蛋白，属于一种优质植物蛋白，在黑麦中已知有4个基因座，每...

问题 WGCNA分析中cluster dendrogram图上的module colors只能显示一种颜色，但在代码中table(moduleColors)显示已分19个模块19种颜色，想问下是哪里出现问题了，谢谢！

做WGCNA分析，数据量比较大，有45783个基因，但样本数只有12个。运行后得到的cluster dendrogram图中的module colors的颜色只能显示出蓝色，但我table(moduleColors)后得到的颜色模块还是很多的。想问下我这个操作是哪里出现问题了呢？万...

文章 命令行 光标移动技巧

一个熟悉linux的人，基本不太会为了移动光标而使用较远的方向键，更不会使用鼠标，那这是怎么做到的呢，我们来简单介绍一下 基础移动光标 Ctrl – a ：移到行首Ctrl – e ：移到行尾Ctrl – b ：往回(左)移动一个字符Ctrl – f ...