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文章 UbuntuLinux系统环境变量配置

...时使用的第一个文件,此文件为系统的每个用户设置环境信息,当用户第一次登录时,该文件被执行。并从/etc/profile.d目录的配置文件中搜集shell的设置。这个文件一般就是调用/etc/bash.bashrc文件。 /etc/bash.bashrc:系统级的bashrc文件...

文章 16S扩增子测序后的PICRUSt预测功能分析原理

...  通过这两个数据,软件就可以建立一个已知物种基因信息的进化树。  2  实现物种输入到基因输出的转化  前面已经根据已知的物种建立起一个带有基因信息(种类和数量)的进化树,通过未知物种的序列信息寻找...

文章 biolinux虚拟机安装指南

...使用课程见: https://zzw.xet.tech/s/3Rcvt0   更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 ggtree绘图lable显示不全如何调整

...umeric(label) > 1)) 可以通过调整绘图的x轴范围,使得lable信息不超出边界: p=ggtree(tree, ladderize=FALSE, size=0.3, branch.length="none",layout="circle")+ geom_tiplab(size=4)+ geom_text2(aes(label=label, subset = !is.na(as.numeric(label)) & as.numeric(label) >...

文章 解读:2019年度高被引科学家名单透漏出哪些信息

就在11月19日,科睿唯安公布了2019年度“高被引科学家”名单,在这份名单中,涵盖了全球近60个国家的6216人次的高被引科学家。我们先一起来看看全球排名前10的名单:图:来源于科睿唯安现在问题来了,到底什么是“高被引...

文章 如何预测蛋白质保守结构域?-InterPro在线工具使用详解

...目了然,将鼠标放置在结构域彩色条上会展示更加详细的信息,除了展示结构域信息外还有GO注释信息。点击Entries选项,这里会更加突出地展示结构域信息,并且可以选择比对数据库,有选择性展示结构域信息。假如想看匹配到...

文章 ggplot2 线型linetype

...符表示 : 加载ggplot2之后 直接查询 ?linetype  可获知相关信息 例如:linetype =4  或者dotdash 都获得相同线型 > df <- data.frame(x = 1:10 , y = 1:10)> f <- ggplot(df, aes(x, y))> f + geom_line(linetype = 4)> f + geom_line(lin...

文章 deepseek绘图之--微生物堆叠柱状图

...、属、种)上的物种相对丰度?堆叠柱状图以其“多维度信息整合”的优势,成为生信论文中的经典可视化工具,通过颜色区分物种、柱高表示丰度,清晰呈现样本间的群落结构差异。然而,传统工具如R(ggplot2, phyloseq)或Pytho...

问题 老师您好,我问过我们这边的一个老师,他是直接用的我的plink_pca.eigenvec文件直接在R绘制的,并且没有用我的分组信息,直接PCA就可以做出来图,他说可能是我的分组有点问题,但是我用这个分组可以完成进化树和structure绘图,做PCA的图却只有框没有点

SampleSpeciesGroupGroup1 Unknown_AQ498-S01-01R0001indigenousAsiaII6AsiaII6 Unknown_AQ498-01R0001indigenousAsiaIAsiaI Unknown_AQ498-01R0002 indigenousChina1China1 Unknown_AQ498-01R0003indigenousAsiaII1AisiaII1 Unknown_AQ498-01R0004indigenousAsiaII2AsiaII2 Unknown_AQ498-01R0005indigenousChina6...

文章 25天破解“粮食杀手”草地贪夜蛾基因组

...个基因组? 想从根子上对一种生物进行防治,基因组的信息自然是少不了的。可是通常印象中,基因组项目是个慢活,从取样到出成果怎么着也得一两年,但只要形势急迫,做一个基因组的速度远超你的想象。 对于这个危害...

文章 测序数据文件中MD5是个啥 ?不要无视我的存在!

...生出一个128位(16字节)的散列值(hash value),用于确保信息传输完整一致。其典型应用就是对一段信息产生信息摘要,防止被篡改。简单点解释,就是MD5会为任何文件或信息产生一个“数字指纹”,如同人的指纹互不相同,不...

问题 问一下老师们,在用get_genefamily_bed.pl 这个脚本,提取自己基因家族位置信息的结果文件总是为空,下面是为的输入文件。perl get_genefamily_bed.pl -in1 SAT.IDlist.txt -in2 Oryza_sativa.IRGSP-1.0.47.gff3 -out MtN3_SAT.bed执行的是条命令。

文章 关于基因家族课程中基因在染色体上位置提取不到问题分析

网易云基因家族课程中,在提取基因在染色体上的位置信息使用到的是一个脚本,大家经常的遇到一个问题就是没有提取出来信息。 下面是可能存在的问题之一: 脚本在处理信息时与gff文件的匹配如下所示: 脚本: 匹配第...

文章 endnote 插入文献 变成临时 大括号{} 不自动更新文献

...下Update Citations and Bibliography,就可以了如下 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

文章 植物代谢通路注释+基因表达可视化神器--Mapman

...以对基因进行功能注释,分析其功能分类以及相关的通路信息,你也能分析基因的表达谱数据,但是你知道如何将二者进行结合吗?在功能分类或者通路图上显示出基因的表达数据?有一个工具可以做到——Mapman! (官方网址:...