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问题 mRNAid_to_geneid.pl出现错误,结果文件只有一行

老师,问答页面不能显示图片,我现在有个问题:gff文件是这样的:,运行命令perl script/mRNAid_to_geneid.pl Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 mRNA2geneID.txt得到的文件是这样的, ,请问怎么解决啊?

文章 KM-plotter在线生存分析

...进行OS生存分析,参数和结果见下图,一秒出结果! 怎么样?是不是很简单快捷!赶快动手试试吧! 相关课程: TCGA-基因差异表达分析、 TCGA-生存分析 、 GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化、WGCNA-加权基因共表达...

问题 hmm文件搜索问题

...得到的Terpene_synth_C_domain_new_out_removed_redundant.txt这个文件怎么是147个?谢谢老师 ! manager@bl8vbox[gene_family_my]  perl script/get_data_by_id.pl Terpene_synth_C_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt Terpene_synth_C_domain_new_out_selected.txt Terpene_synth_C_domain_...

文章 论文投稿之路:SCI期刊选得好,毕业没烦恼!

...配, 然后,你要根据期刊的提交指南和要求修改文章的格式,这样,基本就差不多了。 最后,学霸姐姐提醒: 有些杂志要求文章查重,所以,如果你时间稍微紧急,可先行查重一遍,修改后再投,这样可节省因查重被拒稿的...

问题 BSA分析,野生型亲本,抗性混池

...snp.clean.vcf.gz -r SZCTP1 -b SZCTR5  --N-bulk 29 -m 0.3 --out merge_pl。怎么几乎所有染色体都有定位啊?

问题 群体研究合辑work.sh脚本运行问题

...tError: No module named _sysconfigdata_x86_64_conda_cos7_linux_gnu,请问怎么解决?

问题 如何从已知的基因组里对特定通路上的基因进行筛选鉴定?

目前想研究果实上一条代谢通路上的两个关键基因,想鉴定一下这两个基因,找出这两个基因的所有成员有哪些再进行荧光定量观察其表达模式。果实有已知的基因组,但是怎么从基因组里鉴定这两个基因的成员不会操作?

问题 老师,我在做Mapchart绘制基因染色体位置图时遇到下面的问题

老师,我在做Mapchart绘制基因染色体位置图时遇到下面的问题,这是Date,这个是生成的图,chr2为什么显示不出来呢,当我修改了染色体长度为210965212后,就可以显示出来,怎么解决这个问题呢,谢谢

文章 picrust1 16S 微生物功能预测

...map -o beta_diversity_through_plots  -p beta_params.txt #转换成STAMP格式方便STAMP 差异统计分析 biom_to_stamp.py -m KEGG_Pathways predictions_kegg_at_L2.biom > predictions_kegg_at_L2.spf biom_to_stamp.py -m KEGG_Pathways predictions_kegg_at_L3.biom > predictions_kegg_at_L3.sp...

文章 如何利用iTOL绘制漂亮的进化树

...建邻近(NJ)系统发育树 bootstrap选择1000 1.5保存为*.nwk格式 2、进入iTOL1.0版本的官网 http://itol.embl.de/ 其实也有其他的2个工具可以进行绘制如:Figtree:http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/ Evolview:http://120.202.110.254:8280/evolview/#logi...

问题 WGCNA 表达量低的基因筛选

...文献表达阈值都是选5,个别外文文献阈值0.05,这个阈值怎么确定呀?我的阈值是不是设置的有点低,应该设置1还是5? 望指教,谢谢!

问题 关于treemix的几个问题

...需要一个图作为文章中附件(如下),要调取什么数据,怎么作图呢?

问题 数据准备 检查变量对应有问题

...’成功,从昨天晚上开始试了很多遍都是这样,请问老师怎么解决?辛苦您了,谢谢。

问题 您好,alpha和beta多样性分析sampling-depth 16900如何确定?

###alpha和beta多样性分析 qiime diversity core-metrics-phylogenetic \   --p-sampling-depth 16900 \ 这个16900是怎么确认的?云课堂视频课程这部分被剪掉了,跳了3分钟

问题 泛基因家族鉴定-找不到Bio::SeqIO模块

...lib64/perl5 /usr/share/perl5) at /home/us170/scripts/ParaAT.pl line 7. 该怎么解决?