...己的共享文件夹呢，，我弄了半天打不开啊，我按照视频中的方法进入了gene_family，，，但是里边显示什么都没有啊，，我这个文件夹明明有的啊
...ignmentProgressiveMaxRows from cactus XML 问题出在 Cactus 配置文件中缺少 partialOrderAlignmentProgressiveMaxRows 属性。这个属性控制着渐进式比对过程中允许的最大行数，是 Cactus 进行多序列比对时的一个重要参数。 解决方案： 在github上面找...
在用ALLHIC软件挂载的时候，用如下命令：PreprocessSAMs.pl sample.bwa_aln.sam draft.asm.fasta DPNII。但是运行的时候，出现报错。报错如下： Wed Jul 23 15:32:05 2025: PreprocessSAMs.pl: samtools view -bS sample.bwa_aln.sam -o sample.bwa_aln.bam 2 /share/...
...6)80:0.05)100:0.1)90:0.43;” [2]. 图例是附加在其他设置内容中，包括分支的颜色、标签的颜色、标签背景颜色、标签的装饰、分组标签、Bootstrap值等。以Bootstrap值的显示为例。设置命令为 [3]. 结果显示如下： 此外，我...
...前work space的变量 4、利用object.size()查看前一步返回结果中涉及的变量所占内存 > ls() [1] "aa" "age" "bb" "diabetes" "expression" "geneID" "n" "patientData" [9] "pati...
...分析 4.细胞通讯分析 同样的套路 MDK- NCL在肺癌中又发：https://www.frontiersin.org/journals/immunology/articles/10.3389/fimmu.2025.1546382/full
如随机选取train.txt中的200行保存在新文件 test.txt中 shuf train.txt -n 200 -o test.txt 查看 shuf 命令帮助 “shuf --help” 用法： shuf [选项]... [文件] 或者: shuf -e [选项]... [参数]... 或者: shuf -i LO-HI [选项]...Write a random permutation of th...
使用单细胞转录组学课程中的代码使用monocle2进行轨迹分析报错，之前使用镜像3.0的时候没有问题，自从换成4.0后就出现了以下问题。 这是我的代码：Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle2.r --rds ../05.Find_Markers/CD4.added.celltype.rds \ -g my...
使用单细胞转录组学课程中的代码使用monocle3进行轨迹分析报错，之前使用镜像3.0的时候没有问题，自从换成4.0后就出现了以下问题。 这是我的代码：Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle3.r --rds ../05.Find_Markers/CD4.added.celltype.rds \ --u...
...l -i miRNA_Pre.fa -d Donkey_Hic_genome.20180408.fa -p blastn -e 0.01 -b 5 -v 5 -m 8 -o blast.out #Donkey_Hic_genome.20180408.fa 参考基因组染色体序列 #miRNA_Pre.fa miRNA的前体序列 由于序列可能较短，所以e-value值可调高一些。比对结果如下： bta-miR-34c C...
聚类热图是转录组测序类文章中常见的一种分析内容。今天小编就给大家讲解一个在线绘制聚类热图的方法。 我们使用的在线工具网址： http://www.heatmapper.ca/expression/ 打开后的页面是如下所示： 该在线工具有几个优点： 1...
...常为192.168.1.x（x为1至254之间的任意数字），这个IP在内网中是唯一的，不跟其他人的笔记本IP冲突即可。我这里随机选择了个111。 子网掩码通常为255.255.255.0，这里需要输入的是子网前缀长度24 在“网关”栏中填写默认网关的地...
...快速编写代码。2. 语法纠错：Copilot 可以检测并纠正代码中的语法错误，提供更准确的代码。3. 代码建议：除了补全代码外，Copilot 还可以提供代码结构、函数调用等方面的建议，帮助你更好地组织和优化代码。4. 快速文档查...
...那个包，需要自己去安装相应的包,比如我在运行bwa 过程中，就需要依赖“/lib64/libc.so.6” 这个，解决方案就是自己从新下载一个bwa ，进行安装 2. 软件的运行 软件是一个python 脚本，所以运行时需要有python 2.7。 usage: HECIL.py [-h]...
基因组组装过程中会得到草图的scaffold，需要进一步进行gaps的关闭。TGS-gapcloser 是华大基因开发的，一个利用其他组装或是长度长测序数据对草图进行gap填充的一款软件。 1. 安装 下载 git clone https://github.com/BGI-Qingdao/TGS-GapClose...