问题 老师您好，我在做WGCNA分析时，无法打开'9.Module_membership文件，相关报错截屏和操作文件已发布，请问老师，是哪一步出了问题？该如何解决？谢谢老师。

trait.txtlncRNA_expressionMatrix.rar

问题 老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp是否处于一个高度连锁的区域，属于左边的block还是右边的block呢

问题 老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp处于一个高度连锁的区域吗，属于左边的block还是右边的block呢

问题 做有参转录组分析，在进行基因表达定量的时候，出现如下警告，请问老师这是什么原因呀

23900000 SAM alignment record pairs processed.Warning: Mate records missing for 270457 records; first such record: <SAM_Alignment object: Paired-end read 'A00224:87:H5WHYDSXX:1:2474:9118:3098' aligned to utg9_pilon_pilon_pilon:[3553256,3553424)/+>.24000000 SAM alignment record pairs processed....

文章 进生物实验室之前，这本生存指南请拿好!

...色的实验仪器， 想到自己就要养各种细胞什么的， 是不是感觉马上要大展身手了！ 先别急， 这个时候有些同学可能会好奇：进入实验室之后，首先要学会的第一项操作是什么呢? 是DNA提取？还是PCR？或者是琼脂糖凝胶电...

问题 在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师帮忙解答；（没有root权限，docker镜像用不了，想在外部自己的服务器中使用）

agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl；agat_sp_keep_longest_isoform.pl

文章 CIBERSORT R代码分析

在R语言中运行Cibersort共需要三个文件，分别是（1）官方提供的22种细胞基因集“LM22.txt”；（2）自己的表达矩阵；（3）Cibersort代码。 （1）LM22.txt获取方法： 在Cibersort论文中（https://www.nature.com/articles/nmeth.3337#MOESM207）下载Su...

文章 BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的

R语言代码有兴趣可以了解一下： ###########genotype#############################genotype<-function(){count<-0 if (population_structure=="RIL"){x<-runif(1) if (x<=0.5){count<-1}else{count<-0} }else{for(i in 1:2){x<-runif(1) if (x<=0.5){number<-0.5}else{n...

问题 老师您好 转录因子结合位点怎么预测

一个基因的启动子调控元件和转录因子结合位点是同一个东西吗  我想看一下我的基因启动子区有没有存在的调控基因表达的因子  应该怎么分析  试分析启动子调控元件吗还是分析转录因子结合位点

文章 性价比超高5个重测序发IF=6遗传进化文章

...出预算；今天看到一篇文章，可大大降低做群体遗传进化分析的成本；那就是做混池测序； 拟南芥混池测序遗传进化 作者在意大利北部的阿尔卑斯山脉不同海拔区域选取19-29 个体进行混池高深度测序（平均测序深度19-50X）...

问题 老师，我看到我做的物种的全基因组WRKY基因家族生物学信息分析，已经有人做了，但我数据啥的都弄完了，我还能继续做这个课题吗

问题 老师你好，我想问我在通过cox回归建立lncrna预后模型，最后通过多因素cox回归分析得到的结果，发现有些基因的p值＞0.05，这些基因是不是要剔除

问题 老师您好，我购买了ceRNA分析的网上课程，在下载TCGA数据时出现问题，提示pre_miRNA_miRBase_v22.tsv文件找不到，想请教下老师这个文件怎么获得，谢谢！

问题 老师，这是我做出来的PAV热图，每个基因都是物种独有的，这个PAV热图效果是不是不好，这个PHY家族是否合适继续研究，没办法做聚类分析这些了

问题 基因家族第14课时，基因家族加倍与复制中分析的问题

#找到我们分析的基因家族的共线性分析关系（大片段复制现象）： cd /work/my_gene_family/MCScanX perl /biosoft/MCScanX/MCScanX/downstream_analyses/detect_collinearity_within_gene_families.pl -i crk_family.txt -d mcscan/os.collinearity -o crk.collinear.pairs 这一步分析...