这个树我第一次导出时可以导出完整的树，第二次导出时，基因名称就消失了，所以应该不是老师说的基因名字上有特殊字符的原因，怎么办，愁人。这个是两次导出后的截屏。
...is.这个问题，组装结果中只有一条8000bp左右的序列，请问怎么设置参数才能不 only top reads进行后续分析，而能够使用全部reads进行后续分析
...，寻找影响大熊猫特殊生活习性的特殊基因组成分，本篇综述旨在阐述近十年，从第一个大熊猫基因组发表，到对大熊猫的基因组特征分析、比较基因组学、群体规模变化等相关的新科学研究进展。 正文 1. 大熊猫保...
各位老师好！我想用codeml 批量计算基因的dN/dS, 需要提供树文件 但是程序的控制文件里会叫你填写进化树是有根树还是无根树 这要怎么判断呀？我们用mega phyml这些建树工具生成的进化树是有根还是无根呢？
我看在比较基因组或者基因家族鉴定中有这一部分的分析，请问老师，手头上只有重测序的数据，又想看看某个基因家族是否扩张和加倍的话，可以怎么入手呢? ?
...因组共线性分析。link，text，genome文件按照老师课程中的格式准备。config1.txt 用的是老师给的参考资料中的文件，仅修改了输入文件。最后运行绘图命令时出现如下报错，请问老师这个是哪里出问题了呀？要怎么解决呢？谢谢老...
...入基因kegg富集分析结果和代谢物kegg富集分析结果，文件格式如下： Pathway ID Pvalue RichFactor Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis TRINITY_DN31349_c0_g2 0.0000238520842.1058445728966 Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis TRINITY_DN4141_c1_g1 0.0000238520842...
报错信息如下，是怎么回事：
...-standard non-IUPAC base in the provided input sequence: '13' 请问这个怎么解决呢？
...了染色体，参考基因组还有contig7，contig53，contig164，这种怎么处理呢，-L 参数后面还需要跟contig吗？chr.list表格里还需要加上contig吗？ gatk --java-options "-Xmx400g" GenomicsDBImport \ -L chr.list --tmp-dir $tmpdir -R $REF --batch-size 20 \ --...
最近看到atacseq技术好像挺热的，有人知道具体是怎么样的吗？
我用meme分析motif时，部分蛋白在TBtool中显示没有motif，但网页版中motif location中显示motifsites➕scanned sites时可以看到比较矮的motif，那么怎么能在用TBtool做图时显示每个蛋白都有motif呢？
请问一下MCScanX从网盘上下载下来，应该放在什么位置了？上面的绝对路径/biosoft/MCScanX/MCScanX/MCScanX mcscan/AT中在哪里建立biosoft文件？我是从网站下载的ova包，所以不知道老师的biosoft文件应该怎么建立？谢谢
想问一下，有没有喷过遇到过类似的问题，在油菜的基因组中有很多scaffold，超出了400，显示做不出来，这应该怎么解决？
...现下面的这个问题，说是没有定义undefined variable QD 这是怎么回事？