...Locus ID 指的是我的结果中的gene ID 吗？（3）Scaffold的位置信息应该怎么查找呢？另外，请问老师这些表格中的信息是一个个粘贴过来的吗？
如果不进行过滤，一些污染的没有比对到基因组的那些片段，会不会造成snp的假阳性，有可能不是我们目标物种的snp? 样品污染可能导致重测序mapping rate 值较低的话，这种数据还可以进行gwas分析吗？发文编辑会不会质疑数据的...
...签的颜色、形状和字体等常规编辑，更能导入不同的注释信息，展示更多的数据信息。iTOL网站地址：http://itol.embl.de/login.cgi iTOL使用方法 使用iTOL需要先注册，然后就可以登录。 之后导入进化树文件，如MEGA软件生成的Newick文...
...数一直没好好仔细研究过，如下： #### 增加blast比对结果信息 blast的-outfmt参数，使blastp -help即可查看每个输出格式的信息，如下所示： *** Formatting options -outfmt <String> alignment view options: 0 = Pairwise, 1 = Query-anchored sh...
...用的，分别是Gene ID和GO 功能注释。但文件还包含了其他信息，如symbol，基因的物理坐标信息，UniProt ID等： 将刚刚下载的gene_association.tair 导入到 BiNGO中 数据准备2： 设置GO功能注释分类文件，下载地址：http://geneontology.org/pa...
...为该物种特有的基因或酶，只有这些绿色的框有更详细的信息。KEGG中名字为特定物种种属英文缩写，比如人的糖酵解通路图，hsa00010。 http://www.genome.jp/kegg-bin/show_pathway?hsa00010 第三类、以ko/ec/rn开头的Reference pathway：ko通路中...
...则为1表示删失。其他列为样本对应的性别，年龄等基本信息。 2. 进行生存分析 这里根据性别这个二分类变量，采用KM算法来估计生存曲线，代码如下(summary结果只显示部分） > library("survival") > library("survminer") > kmfit<-s...
...aa的保守区。这个在后续进行基因结构分析，染色体位置信息及其他分析时要怎么做呀？谢谢 追问一下，不好意思，还不是很懂，我看后续用来提取位置信息的用的是domain new out removed redundant.txt 这个文件，我这个亚族没有这个...
...annotation.gff 和 gemoma.evm.format.gff3中都没有这条序列的注释信息，在运行 PASA更新时就会导致找不到这个基因序列的注释信息报错，请问老师这种该怎么解决
...会很多，一般选择第一个，如下图所示：3. 查看位点详细信息，下载结合位点的特性信息， 可以预测转录因子调控哪些基因。
...灰度值都反映了图像所对应芯片位置的荧光分子相对强度信息。利用灰度图可以查看芯片的质量情况，最好 没有杂质，例如太高或者太低强度的信号点，刮擦的痕迹，背景太高等等，整个图像比较均一，背景均一。 基于affy包...
选取需要的列，之前有的相同的列信息去除。保留第一列barcode，方便合并； cut -f 1,27- UCell.metadata.tsv >UCell.metadata1.tsvcut -f 1,27- infercnv.metadata.tsv >infercnv.metadata1.tsvcut -f 1,27- CytoTRACE2.metadata.tsv >CytoTRACE2.metadata1....
...索，然后将结果输出。grep还支持正则表达式进行复杂的信息捕获。 基本语法 grep [选项] PATTERN [FILE...]# PATTERN：要搜索的字符串或正则表达式。# FILE：要搜索的文件名，多个文件用空格分隔。 其中每个[选项]所代表的意思如下...
老师，请问下我的这个为什么一直报错，我只有一年的数据，即使我加了Header那一行也会报错，我的性状是性别，二分类性状，不知道能不能用这个代码计算，以下是我的表型信息以及报错信息，望解答，谢谢！Group.rm_outers.txt
在使用braker时，偶尔会遇到~/.gm_key过期的错误。报错信息如下： 这时候就需要下载新的密钥文件，下载地址：http://exon.gatech.edu/GeneMark/license_download.cgi 先选好软件： 然后填写好信息，点击同意： 跳转到如下界面，下载64...