找到约 15 条结果

问题 基因家族分析发现染色体以外的成员

...的,因为我做的是藻的基因家族分析,而藻的基因组文件除了33条染色体以外,还有很多其他的序列如下图: 这是藻的基因组gff3文件的前面一部分,可以看出前面应该是染色体,后面还有很多既不是叶绿体基因的为知序列...

文章 Linux qr命令生成二维码

Linux qr命令可以将网站链接生成一个二维码,命令如下: qr "https://www.omicsclass.com/" 运行上述命令生成如下图片: 此外,我们在网易云课堂上有各种教学视频,有兴趣可以了解一下: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思...

文章 一键显示影响因子与分区

...装Scholarscope插件。 1. 安装谷歌浏览器,如果不能正常使谷歌浏览器的话,可以参考文章《谷歌学术搜索可以了!》安装一下谷歌助手。 2. 点击以下链接进入chrome网上应商店,点击“添加至chrome”完成安装即可。 https://c...

文章 MITE_Hunter 第六步报错 aln not exits

...原因 发现第六步执行: 在MITE_Hunter_worker3.pl这个文件check发现在比对之前都没有问题,但是比对的时候选择的软件不存在了,所以未能生成aln文件 3. 解决办法 修改MITE_Hunter_worker3.pl的147、150、263、266行的muscle所在位置即可...

文章 韩国女星之死——Nature子刊:名人自杀会带来模仿效应

...生问题之一,2016年,全球年龄标化自杀率为每年每10万人10.5例(10.5/10万)。而韩国的情况更为严峻, 2015年的自杀率为25.8 / 10万,比全球年龄标化自杀率高出2倍以上,自杀是韩国2018年第五大最常见的死因,是10至39岁年龄段的主...

文章 基因家族分析--低成本SCI文章思路

...《基因家族视频课程》 生物信息发展迅猛,公共数据库存放着海量的数据,如何利这些公共数据结合自己的实验发一篇SCI?基因家族分析无疑是个低投入、高产出的好选择。今天我们就拿2018年发表的一篇文献跟大家聊聊这...

问题 qPCR如何2^-ΔΔCt法计算某一基因相对于内参基因的表达量?

在做qPCR时,想比较根、茎、叶某一基因相对于其根、茎、叶内参基因的相对表达量。这样的情况应该怎样计算呀?谢谢!

问题 请问老师NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息的问题。

...是这个超家族的pfam号,这个号可以来在我需要的物种研究我的这个基因家族吗?

问题 更改文件及perl脚本后get_gene_weizhi.pl提取文本依旧为空。

根据老师的意见:将"gene:"在脚本及文件删除 生成文本文档依然为空。。。想请问一下是不是我的染色体的格式是chr4.4造成的这种原因呢,还是其他什么问题。麻烦老师再次解答~ 老师,文件及路径我都核对过,没有问题: ...

文章 使官方gdc-client软件下载TCGA数据

...为不同,数据都整合在GDC(Genomic Data Commons)的DATA PORTAL,网址:https://portal.gdc.cancer.gov/ 建议大家先从Exploration页面筛选数据再到Repository页面筛选,最后下载Manifest文件,这里以乳腺癌表达数据Manifest文件下载为例给大家说明...

问题 bootstrap consensus tree导出nwk文件格式时Branch_lengths选项无法选择

但是在导出Original Tree时就可以选择,而且我在忽略Branch_lengths选项导出nwk文件时,发现树的结果与生成的树有变化,想请教老师如何设置我可以选择Branch_lengths选项,bootstrap=1000,画树时的每一步设置都与课程的操作一样

问题 cafe进行基因家族扩张和收缩分析,重复报错Families with largest size differentials

...分析时,报错Families with largest size differentials,按照脚本的提示,删除掉报错的这些家族后重新运行cafe5仍然报错,多次循环之后还是一直报错如下,请问该如何解决?望各位老师回答,谢谢!

文章 Windows里MaxQuant下载与安装

...以去linux系统上使MaxQuant进行搜库分析,     Linux系统MaxQuan操作笔记:https://www.omicsclass.com/article/2245

问题 单细胞测序数据KEGG富集分析执行代码后报错

...代码报错,且已经参考RNAseq有参转录组数据自主分析分析的方法,--ann.db org.Ss.eg.db 和--organism ssc均按照要求进行修改,依然报错,想知道问题出在哪里?怎么解决?谢谢老师

问题 基因家族第14课时,基因家族加倍与复制分析的问题

...o crk.collinear.pairs 这一步分析后,产生的.collinear.pairs文件,没有找到对应的复制基因,是我分析的基因确实没有加倍与复制,还是输入的crk_family.txt文件格式有问题(确实是制表符分隔的)? 详情见图