我看组学大讲堂“Linux生信分析环境搭建”一节里,安装bio-linux需要它的ova包,可是提供的下载bio-linux ova包的百度网盘地址:pan.baidu.com/s/1bMOLEu,已经不存在这个资源文件了,怎么办?求解决办法。
我手里有一个F2性状分离群体,想问下如果使用BSA方法去做基因定位的时候,每个混池应该取多少样品比较合适?重测序的时候深度怎么选择?
...子生物学研究方法的发展,很多的研究领域都越来越多的分析到了蛋白层面,下面我们就简单介绍几种常用的蛋白互作研究方法: 酵母双杂交: 酵母双杂交由Fields在1989年提出,它的产生是基于对真核细胞转录因子特别是酵...
老师您好,我看到您在2021-03-20提问的问题:在做WGCNA分析时,得到的CytoscapeInput-edges文件都是空的,请问该如何解决?我也遇到了相同的问题,请问您后来如何解决的呢?感谢您!
按着视频里面操作但是 无法运行,只要是和plink有关的都不行, 进化树可以正常运行
老师, 我的泛基因组中,有三个品系的基因组命名有“_”,如图所示。 所以我进行这个操作时那三个品系都被删除了,我应该怎么改一下"s/_/\t/g"|这个命令啊。 #提取基因的位置坐标信息 cat ${svgene}_gene.list|sed "s/_/\t/g"|while ...
在用GEMMA软件进行GWAS分析的时候,需要加入Q矩阵,有一个疑问。为什么这个命令中,cat ../03.STRUCTURE/admixture.4.Q|cut -d " " -f 1-3 >4.Q。用的是admixture.4.Q的结果,是跟群体结构的CV error有关吗?而且后边为什么只取了前3列,生成4.Q...
在用IsoSeq3分析时 1)ccs --minLength=200 --minReadScore=0.75 --minPredictedAccuracy=0.8 --numThreads=20 --noPolish --minPasses=1 --reportFile=test.ccs_report.txt test.subreads.bam test.ccs.bam 2)lima test.ccs.bam adapter.fasta test.demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi 在第二步生成的...