各位朋友、老师您好,应用MEGA5构建好的进化树后,在结论和讨论部分应该如何进行写那?另外怎样从进化树中将不同的序列进行分类?谢谢!
老师您好,我按照课程里面的代码,运行到保存数据的时候出现了报错,麻烦您帮我看下这个问题咋解决呀,我看不懂什么原因,谢谢了
已经做出来图了,也在图上用红线显示了共线性基因,但是由于该物种原基因组染色体命名问题(染色体名字很长),导致作图时染色体名字重叠,有没有办法解决啊,或者直接把染色体重命名为1234这种
老师您好,关于这个问题(https://www.omicsclass.com/question/8454),我还有一点不太明白,想请教您一下。 LD.p.TriangleV (上图)文件初次看有些困惑,想请问这个文件每一行、每一列分别代表什么?另外,LD.p.TriangleV 中的每一行、...
微生物16S分析物种功能预测PICRUSt2部分,进行代谢通路差异比较可视化时,如果是三组之间比较分析,这个代码应该怎么修改,谢谢老师!Rscript $scriptdir/ggpicrust2.r --daa_method $m \ --pathway_table q2-picrust2_output/pathway_abundance.qza \ ...
...基因组名字Yugu1_T2T.genome有误),但在家族成员存在缺失分析时,awk 'FNR>1{print $1"\t"$2"_"$3}' final.last.gene.pair.txt > foxtail_millet.pan-genes.list 整理格式时,已经均进行了调整(名字纠正),但经过perl /work/scripts/PAV_list.pl -pangene...
通过学习TCGA生存分析课程,得到了几个基因的risk score,但现在我想用自己的样本进行验证,是不是必须测序,就用定量pcr可以验证吗,该怎么计算?
请问老师,购买的基因家族课程过期了,docker以及里面的基因家族分析包还是镜像,都不能用了吗?