做转录组调控研究可用的技术手段逐渐增多，各种数据的联合分析变得越来越重要。转录调控家族在CNS上也不再总是mRNA、LncRNA这些老面孔，近年来circRNAs可谓是风生水起，大家一起来看看这个circRNAs到底是何方神圣吧？说不定可...
...表达定量的方法，他的计算方法有很多，常用的相对定量数据分析方法是KJ Livak（Applied Biosystems）等人在2001年提出的“比较Ct法相对定量”，即：利用ΔCt值差异来推算基因表达差异（Ct目的基因 – Ct内参基因 = ΔCt），该方法的...
...应的转录组文章，今天我们来看第二篇同样以这个转录组数据为基础的第二篇SCI文章，这一次作者关注点更加细致，下面听我娓娓道来：积雪草酸是由香树脂醇α-amyrin在C-2α, C-23 和C-28三个位置进行3次羟基化形成的。（红色框内...
...SCI好思路；学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据结果理解不深入？图表看不懂？这就是你转录组数据不会挖掘、文章不会撰写的原因，让我带你一起深入了解转录组数据结果，学习链接：转录组（有参）结果解读；...
...NA和27个差异miRNA。已有全部circRNA与miRNA的互作关系。通过筛选，得到64个差异circRNA和23个差异miRNA及其互作关系。 2. ceRNA调控机制：lncRNA与miRNA的互作 通过分析得到17个差异lncRNA和27个差异miRNA。已有全部lncRNA与miRNA的互作关系。...
...nut during domestication | Genome Biology | Full Text (biomedcentral.com) 数据可用性：The entire genome resequencing data have been deposited at GenBank under the accession PRJNA356989. 想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据，看了一些下载教程，方法各异，...
基因家族用hmmer筛选时e值用0.01还是0.001比较好，而且我的pfam号有好多个？是要全部都搜索吗？
我通过转录组和蛋白质组学分析筛选了一些关键基因，想进一步分析转录因子结合调控
TCGA筛选出来的差异基因绘制火山图的时候出现这样的提示，是什么原因呢？怎么解决，对后面分析有影响吗？
老师您好，我做PPI图时，按照视屏教学中的步骤使用的vlookup，但筛选不出结果，请问是excel的问题还是其他什么原因？
...量分析对生存的影响。 R语言中的生存分析R包介绍 R是数据分析常用的软件之一，通过各种功能强大的R包，可以简单方便的实现各种分析。在R语言中，能够进行生存分析的R包很多，survival和survminer是其中最基本的两个，survival...
546就是没有经过筛选的，所以我是不是把下面的的代码用错了？ 我不知道下面的代码使用在哪一步，并且不清楚有什么要修改的地方？
...基因组中，总共鉴定出35个TaPHT1，结合作者从Phytozome或NCBI数据库中收集了16种植物的109种PHT1蛋白质的序列，及一个酵母蛋白，共145个PHT1基因蛋白构建系统发育树；PHT1蛋白分为八个亚家族（I，II，III，IV，V，VI，VII和VIII组），小...
你好，我用HMEER搜索基因家族的蛋白序列，筛选后进行系统发育树的构建时，有一些不属于任何一个家族，是我查找的序列有问题吗？谢谢老师 追加:我从NCBI CDD和Pfam上手动确认了结构域，都有保守结构域的。谢谢
...q）或Python（matplotlib, seaborn）的绘图流程往往涉及复杂的数据预处理、颜色搭配调试和图例优化，耗费时间，令生信新手望而生畏。 AI大模型的出现彻底颠覆了这一困境。只需上传你的OTU丰度表或物种相对丰度矩阵（如CSV格式...