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问题 老师,做顺势原件分析出现这种情况是什么原因?求解答

问题 你好,我想问一下,要做小麦基因家族分析,但是有无参转录组数据,可以做吗?

老师你好,重新做有参分析的话,是要公司来做吗?我是特别理解。谢谢

问题 做群体遗传分析,需要把indel提取出来嘛只用SNP的vcf文件?

公司给的是filtered_snp.vcf.gz和 filtered_indel.vcf.gz,我是是应该合并起来再进行vcftools过滤后,进行群体分析

问题 为什么orthofinder分析基因家族时候一个基因也算一个基因家族?

什么orthofinder分析基因家族时候一个基因也算一个基因家族,那算特有的基因家族那个upset的时候,是属于算的特有的单基因了吗,教程里没有解释为什么一个基因也算一个基因家族

问题 泛基因家族分析-SV和基因表达量

fpkm_SV_to_draw.2.txt文件中,为啥结果是这样,基因ID对应同一个基因组,这对吧。

问题 Linux生信分析用苹果电脑需要什么配置

如果是2019款macbook pro 13寸和15寸各自的最低配置和最适配置是什么?

问题 基因组间共线性分析时报错

老师您好,在输入代码python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7后显示报错,请教一下怎么解决

问题 请问老师TCGA同的癌症可以一起分析吗?

比如我把TCGA肺鳞癌和肺腺癌的全部数据下,整体进行标准化处理,这样合理吗?

文章 玉米根单细胞转录组细胞类型注释代码

...基因非常少,无法确定这些物种细胞类型将难以进行后续分析。但是可以利用生物信息学方法,跨物种寻找同源基因来定位标记基因。下面是我收集的玉米根同细胞类型标记基因:玉米根细胞类型注释MARKER收集玉米细胞亚型标...

问题 TCGA-基因差异表达分析课程中您写的perl脚本如何运行?

在您TCGA-基因差异表达分析课程中,数据下中提取Gene表达量矩阵时您用到了perl脚本,但是视里您没有将如何在自己的电脑里运行。我双击您写的perl脚本,或者用cmd命令行,都运行失败。恳请您百忙之中予以解答,万分感谢~

问题 共线性分析获取基因对应的蛋白序列信息出问题

这一步红色怎么回事,我在01的蛋白文件也是有的

问题 老师您好,我现在正在做500人样本的宏基因组分析,将其分成三组,目的是为了找出三组之间的差异性菌群及菌群功能分析,现在遇到了一些问题,详情如下,我已经完成了宏基因组分析的绝大部分流程,物种丰度也完成了,现在已经用salmon识别了基因,得到了基因丰度,接下来的一步就是要比对基因名称和功能,请问具体怎么执行操作,我是很懂,谢谢老师

问题 TCGA生存分析课程risk socore问题

请问按照课程中的代码来,要怎么导出示范论文里的这个公式?或者是说找出随便一个基因来根据表达量计算它的风险值?

问题 微生物16S分析时候,两端测序数据拼接

...下4000多了,想问下是什么原因造成的?还能用于后续的分析吗?

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 融合基因的分析

Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq 3)  中融合基因的分析,可以采用Cupcake 中的“fusion_finder.py” 这个脚本来分析。 fusion_finder.py --input hq_isoforms.fastq --fq -s hq_isoforms.fastq.sorted.sam -o lq_isoforms.fasta.fusion --cluster_report_csv cluster_report.csv 参...