老师你好,重新做有参分析的话,是要公司来做吗?我不是特别理解。谢谢
公司给的是filtered_snp.vcf.gz和 filtered_indel.vcf.gz,我是不是应该合并起来再进行vcftools过滤后,进行群体分析?
什么orthofinder分析基因家族时候一个基因也算一个基因家族,那算特有的基因家族那个upset的时候,不是属于算的特有的单基因了吗,教程里没有解释为什么一个基因也算一个基因家族
fpkm_SV_to_draw.2.txt文件中,为啥结果是这样,基因ID对应同一个基因组,这不对吧。
如果是2019款macbook pro 13寸和15寸各自的最低配置和最适配置是什么?
老师您好,在输入代码python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7后显示报错,请教一下怎么解决
比如我把TCGA肺鳞癌和肺腺癌的全部数据下载,整体进行标准化处理,这样合理吗?
...基因非常少,无法确定这些物种细胞类型将难以进行后续分析。但是可以利用生物信息学方法,跨物种寻找同源基因来定位标记基因。下面是我收集的玉米根不同细胞类型标记基因:玉米根细胞类型注释MARKER收集玉米细胞亚型标...
在您TCGA-基因差异表达分析课程中,数据下载中提取Gene表达量矩阵时您用到了perl脚本,但是视频里您没有将如何在自己的电脑里运行。我双击您写的perl脚本,或者用cmd命令行,都运行失败。恳请您百忙之中予以解答,万分感谢~
这一步红色怎么回事,我在01的蛋白文件也是有的
请问按照课程中的代码来,要怎么导出示范论文里的这个公式?或者是说找出随便一个基因来根据表达量计算它的风险值?
...下4000多了,想问下是什么原因造成的?还能用于后续的分析吗?
Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq 3) 中融合基因的分析,可以采用Cupcake 中的“fusion_finder.py” 这个脚本来分析。 fusion_finder.py --input hq_isoforms.fastq --fq -s hq_isoforms.fastq.sorted.sam -o lq_isoforms.fasta.fusion --cluster_report_csv cluster_report.csv 参...