OTU分析按照视频中方法一(pick_de_novo_otus.py)做的,显示usearch版本不对,应该怎么办?
老师,在泛基因家族分析中,家族成员鉴定部分,得到了112个基因型的所有成员,并经NCBI等网站验证结构域后得到了可靠成员列表直接相加就可以吗,不需要去冗余吗?cat *.WRKYgene.list > maize.WRKYgene.list
老师您好,我看了这个文章,鉴定了9个物种,后面的生理实验只用了葡萄一种,我可以选择其他八个物种中的一个再进行鉴定和后续的实验吗
R语言中的Cox模型分析 单变量Cox回归 library("survival")library("survminer")res.cox <- coxph(Surv(time, status) ~ sex, data = lung) summary(res.cox)res.cox <- coxph(Surv(time, status) ~ sex, data = lung)summary(res.cox) summary的结果: Call:coxph(formula = Surv(time, sta...
我已经按照下边答案中说明做了,但是为什么还是不能成功呢,出现的问题如下图。
1.抽平方法: single_rarefaction.py -i pick_de_novo_otus/otu_table_clean.biom -o pick_de_novo_otus/otu_table_clean_rare.biom -d 2032 2.css方法或者deseq2方法 normalize_table.py -i otu_table_clean.biom -a CSS -o otu_table_clean_css.biomnormalize_table.py -i otu_table_clean.biom -a DESeq...
COX教程里通过ROC曲线确定最佳cut off,这个cut-off值大于1 也是正确的么,文章中怎么解释?
...此必须要拥有十分庞大的数据去将可靠的信息从背景噪音中分离出来。 研究者为了检测25种精神和神经疾病的遗传模式,对265,218例病患和 784,643例conrols 进行了全基因组关联分析(GWAS)。同时在1,191,588个体中检测了脑部疾病和17...
基因家族提取用hmmsearch --domtblout result.txt --cut_tc zf-C2H2.hmm Fvesca_226_v1.1.protein.fa 时提示 Failed to open tabular per-dom output file result.txt for writing
请问为什么我的结果中染色体出现了 这种情况
在perl语言中怎么设置命令行参数,如perl test.pl -i A.txt -o B.text,像这种指定参数,-i为输入文件,-o为输出文件,该怎么设置?
...幕都能感受到作者的绝望和愤怒, 原文如下: 大致的中文意思是这样的: 这是我们的最最最最最新版手稿,我要改吐了。 我已经从头到尾修改过手稿了! 现在我已经受够了!希望能够满足你们和嗜血的审稿人。 1、我不...
请问性别和年纪为随机效应还是固定效应呢?将性别和年纪添加到混合线性模型中去有什么办法呢?
...批量的处理一下,添加上gene行信息,也就是mRNA信息直接用于基因信息,方便我们的分析流程处理数据: 可以用awk命令批量添加gene行,把mRNA的ID作为基因ID,并且在mRNA行添加Parent信息: awk -F"[\t=]" 'BEGIN{OFS="\t"}{if($3=="mRNA"){p...
...,在恋爱次数上,博士高居榜首!! 从数据上来看,博士中,女博士的恋爱次数更高,平均为7.12次, 男博士只有6.47次,拖了女博士的后腿。。。。 学霸姐姐看到这个数据后的第一反应是: 谁把我的恋爱次数给平均了!!请还...