文章 CORNERSTONE | DevOps平台是如何实现开发效率的双倍提升？

...心内容之一。就让我们来一起从软件生命周期的业务流与工作流，探讨DevOps实践效率提升的方向与方法吧。 一、CORNERSTONE | DevOps之“流”分析 软件工程将软件的生命周期定义为问题定义、需求分析、软件设计、程序编码、...

文章 2019年国自然基金热点方向——CRISPR/Cas9技术

...国自然基金的初审结果已经公布了， 这个预测准不准呢?额，可能暂且还没有数据来证明， 但是——众所周知，SCI是国自然的敲门砖，CRISPR/Cas自诞生以来，迅速发展，已经成为生命科学领域最耀眼、最有前景的技术， 并且，...

问题 map bwa出错

...是根据我自己的样本名字改的：bwa mem  $BWA_INDEX  $workdir/2.data_qc/${i}.man_1.clean.fastq \     $workdir/2.data_qc/${i}.man_2.clean.fastq -t 2 -M \      -R "@RG\tID:${i}\tLB:${i}\tPL:ILLUMINA\tSM:${i}" \       |samtools view -bS -h - > $workdir/3.map/bwa/${i}.bam 出...

文章 Science：美国P4实验室“没过安全检查”，暂停使用......

...美国陆军传染病研究所，因未能通过安全检查，而被暂停工作 这个新闻是8月6日报道的，内容只有短短几行字： 学霸姐姐给大家简单翻译一下： 大致意思是：亚特兰大疾病控制和预防中心在6月份的一次检查发现， 美国陆...

文章 Python虚拟环境解决不兼容问题

...e # 查看一下当前的python $ which python /usr/bin/python # 创建工作目录，方便以后关联虚拟环境 $ mkdir Workdir $ cd Workdir # 创建虚拟环境，命名为venv, 名称可以随便取，最好是能辅助记忆的名称 $ virtualenv venv New python executable in /Users/zha...

问题 老师您好，我在看您的视频学习docker的时候，转录组比对的时候，结果空的，后续工作该怎么办呀

问题 老师您好，我在看您的视频学习docker的时候，转录组比对的时候，结果空的，后续工作该怎么办呀

文章 三分钟让你理解什么是敏捷开发，这才是敏捷开发......

...与产品密切相关的一个知识领域，同时也是产品经理日常工作中经常要负责的一部分内容。别问我为什么不是项目经理负责，因为很多公司没有…… 本文结合实际工作实践以及亲身使用CORNERSTONE项目管理工具经验，深入浅出介...

问题 泛基因集执行命令时，由syn.txt文件到最后output.txt和final.last.gene.pair.txt文件生成时会丢失一些基因吗？我做自己的物种分析时发现丢失了一些基因，是什么原因？这正常吗

...三段命令 # 匹配位置信息 awk 'NR==FNR{a[$4]=$0;next}NR>FNR{if($2 in a)print a[$2]}' all.bed output.txt \  | awk '{ print $1"\t"$2"\t"$3}' | sed "s/_/\t/g" | paste output.txt - > last.gene.pair.txt     # 把第二列的前缀去掉 awk '{split($2, a, "_"); $2 = a[length(a)] " " $3;...

文章 Sci-hub一键下载文献-真香！内有详细设置教程！

我们做科研的，下文献、读文献是必不可少的工作，但是由于期刊的种种限制，很多文献都无法顺利下载。Sci-hub应运而生，深受广大科研工作者的认可和青睐，其使用率颇高。但是每一次都需要复制文献标题，然后再使用Sci-hub...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BRCA乳腺癌(E-MTAB-8107)

...的数据，其中就有这个数据，我们可以从中分离出来（GSE210347）： 文章地址PanCAF :https://www.nature.com/articles/s41467-022-34395-2 数据下载： wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE210nnn/GSE210347/suppl/GSE210347%5Fcounts.Rds.gz -O GSE210347_counts.R...

文章 安装R包的几种方法

...led.packages() #查看已安装包install.packages("packageName") 2.找到R包下载地址后安装 url <- "https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/rvcheck/rvcheck_0.1.8.tar.gz"install.packages(url,repos = NULL,type = "source") 3.R包下载到本地后安装 download.file("ht...

文章 cactus-bin-v2.9.9 安装笔记

... the distribution and cd into the cactus directory:```tar -xzf cactus-bin-v2.9.9.tar.gzcd cactus-bin-v2.9.9```## GPU Patch:When using GPU support since v2.9.4, please make sure to pass in the patched config file with `--configFile` (download the patch from the [releases](https://github.com/Comparati...

问题 做psmc的时候，显示没有这个get_fa_by_id.pl

...@cbc85a3c34bd  16:10:01 /work/3.map/psmc]# get_fa_by_id.pl chr1.list HH14_2.psmc.fa HH14_2.Chr.psmc.fa bash: /work/3.map/scripts/get_fa_by_id.pl: /biosoft/miniconda/bin/perl: bad interpreter: No such file or directory

问题 老师，这个警告问题大不大

Wrote 92128018 bytes to primary GFM file: Amphitetranychus_viennensis.genome.1.ht2Wrote 35712720 bytes to secondary GFM file: Amphitetranychus_viennensis.genome.2.ht2Re-opening _in1 and _in2 as input streamsReturning from GFM constructorWarning: a local graph exploded (offset: 1239040, length: 57344...