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问题 circos 字体大小与比例问题

...deogram> karyotype=/Users/823371123/Desktop/work/SBT/棉花基因家族分析/共线性分析/ghgrga/quan/chr.info.txt <links>     bezier_radius=0r     bezier_radius_purity=0.75     color=black     crest=0.5     <link>         bezier_radius=0r         bezier...

问题 P值与矫正后P值

最近分析的好多组数据矫正后P值都是这样,或者干脆全部是1,用limma包分析的,请问这是什么原因导致的呢?能能直接用P值呢?

问题 16S课程 02.feature_table这一节课中 dada2方法无法生成数据

...们这么设置--p-trunc-len-f 150 --p-trunc-len-r 140 导出的table后续分析了 --p-trim-left-f 0 --p-trim-left-r 0 \    --p-trunc-len-f 300 --p-trunc-len-r 260 \想请老师帮忙解答一下!

问题 python版本的MCScan出错,在画共线性图时

出错的地方。 bed1 bed2 layout文件 seqids文件 知道哪有问题

文章 IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践

TCGA数据挖掘已经烂大街, 单细胞与空间转录组数据分析近年来十分火热,公开的数据也越来越多, 如果结合单细胞数据做生信挖掘分析发文相对新颖且容易得多,接下来我们介绍相应的挖掘文章思路,再利用我们提供的代码可以轻松...

文章 人类基因组版本说明:hg19 b37 grch37

基因组介绍:https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360035890951-Human-genome-reference-builds-GRCh38-or-hg38-b37-hg19  基因组下这里:https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360035890711-GRCh37-hg19-b37-humanG1Kv37-Human-Reference-Discrepancies  hg19 (ucsc.hg...

文章 R语言基础入门—判断语句

...ase 位置值,如果整数在位置的范围内则返回 NULL。如果匹配到多个值则返回第一个。expression如果是字符串,则对应的是 case 中的变量名对应的值,没有匹配则没有返回值。switch 没有默认参数可用。 以下实例返回第三个值: ...

问题 基因ID、cds ID与蛋白ID三者均一致

老师您好!我在分析鸡的基因家族的时候,发现鸡的基因ID、mRNA ID与蛋白ID之间都是没规律的。蛋白ID、基因ID、mTNA ID前面几个字母分别以P、G、T结尾,这个很容易解决。但后面的11位数字编码却毫无规律可谈,蛋白fa文件中,蛋...

文章 顺式作用元件分布图绘制

...用元件进行展示。 今天给大家介绍一款非常简单实用的在线软件GSDS:访问地址:http://gsds.cbi.pku.edu.cn;GSDS全拼是:Gene Structure Display Server ,是一款很好用的基因结构绘图软件,今天只给大家介绍下如何用GSDS进行顺式作用元件...

文章 R包更新网站

...踪R包的更新进展或者新发布的R包,及时进行本地安装或版本迭代,可以参考下方链接,依据时间显示R包情况: http://lib.stat.cmu.edu/R/CRAN/web/packages/available_packages_by_date.html 或者可以通过名称显示目前有效的R包: http://lib.stat.cm...

文章 HTML 转 PDF

... 看上面的信息可知,写此篇时我系统里装的 wkhtmltopdf 的版本是 0.12.3.2 开始使用 命令格式:wkhtmltopdf [GLOBAL OPTION]... [OBJECT]... <output file> 命令行工具自然是没有图形界面的。 光看上面的命令格式好像太简单理解应该怎么用...

问题 LD分析相关问题

老师您好,关于这个问题(https://www.omicsclass.com/question/8454),我还有一点太明白,想请教您一下。 LD.p.TriangleV (上图)文件初次看有些困惑,想请问这个文件每一行、每一列分别代表什么?另外,LD.p.TriangleV 中的每一行、...

问题 扩增子分析结果的差异显著性的p值在哪里找到

在输出结果文件夹里好像没有找到

文章 R语言-Cox比例风险模型

...归模型。该模型以生存结局和生存时间为应变量,可同时分析众多因素对生存期的影响,能分析带有截尾生存时间的资料,且要求估计资料的生存分布类型 Cox模型的基本假设为: 在任意一个时间点,两组人群发生时间的风...

文章 环境因子分析

--- title: "环境因子分析" author: "Omicsgene" date: "2020年11月17日" output: html_document --- ![image](https://note.youdao.com/yws/api/group/92990402/noteresource/D0C43D04435648A4A5A9B36556716345/version/421?method=get-resource&shareToken=76A1AE2F0EB444EB93D783F84996259D&am...