问题 cafe进行基因家族扩张和收缩分析，重复报错Families with largest size differentials

老师好，我在做基因家族扩张和收缩分析时，报错Families with largest size differentials，按照脚本中的提示，删除掉报错的这些家族后重新运行cafe5仍然报错，多次循环之后还是一直报错如下，请问该如何解决？望各位老师回答，谢谢...

问题 docker共线性分析bash: sudo: command not found

老师您好，前面问题是由于文件路径错误已经找到，但是黄色圈出的问题一直找不到原因，百度后还是找不到，麻烦老师解决了，非常感谢老师！！！

问题 单细胞测序的细胞通讯分析 cellchat

用的课程里提供的代码跑的，出来的这个图为什么最后多了没有对应的一列，而且这里应该展示的是在S组中上调的signaling，但是为什么感觉N组的圆圈的颜色比S组的更深呢？而且为什么HLA-DQB1和CD4在上调和下调中都出现了呢？

文章 NBT同时两篇文章：单细胞数据分析流程 比较

7种单细胞测序技术比较:https://www.nature.com/articles/s41587-020-0465-8 13种单细胞测序技术比较：https://www.nature.com/articles/s41587-020-0469-4

问题 对代谢数据的黄酮和酚酸与转录组进行WGCNA分析，如何准备文件？

...录和代谢，现在主要想关注黄酮和酚酸，我想做一个WGCNA分析，找到跟黄酮和酚酸含量密切相关的基因。我需要准备哪些数据文件呢？（1）是将黄酮和酚酸代谢物含量数据放一起，还是分别做黄酮和酚酸的 （2）基因数据，是用...

问题 微生物多样性分析的程序复制shell中不能运行

蓝色背景的是我shell中的程序，黑色的是视频中的程序，在运行到原始测序数据两端合并时，出现以下错误，请指教问题所在

问题 不同物种间的共线性分析，如何配置simple文件，在图中标出红色

最后这些标色号的序列如何筛选出来，之后运行什么脚本标色

问题 isoseq3分析lima去除测序引物问题

大家好， 我用lima去除pacbio的barcode的过程中出现这样的问题： barcode序列是这样的： 5’ – pATCTCTCTCTTTTCCTCCTCCTCCGTTGTTGTTGTTGAGAGAGAT – 3’ lima ../m54220_181204_080956.subreads.ccs.bam primers.fasta test.demux.ccs.bam --isoseq --no-pbi  有谁能给...

问题 基因家族分析，最长转录本，复制的命令，还是报错。咋整

Using standard /share/work/biosoft/perl/perl-5.22.1/lib/site_perl/5.22.1/auto/share/dist/AGAT/config.yaml file File .longest_isoform.gff3 already exist.

问题 求助大佬，想做基因家族分析，目标物种在网上只有三个组装的基因组，JGI上和NCBI其中一个都没有组装到染色体层面，NCBI另一个组装到染色体了，但是没有gff文件和蛋白序列，这种情况应该怎么办？不能做与染色体位置有关的分析了吗？

问题 BSA分析中ED法和SNP-index的方法，哪个更加准确一些？

问题 在转录因子富集分析课程中，Q-value 是0，该怎样理解呢?

问题 请问我要分析的物种里gff文件没有染色体命名信息，该怎么办

问题 老师您好！请问wgcna可以将一个临床特征分成五个水平进行分析吗？

问题 我想学习一下python版MCScanX绘制分析基因共线性，请问我要买哪个课程？