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文章 基于R实现统计中的检验方法---T检验

...前提条件是相同的,即正态性额方差齐性。(参考:t检验方差分析的前提条件及应用误区_百度文库(链接见文末)说的非常详细) 2.分类 单总T检验(单独样本T检验),双总T检验(一是独立样本T检验,另一是配对样本T检验)...

文章 win10/win7系统下无法重命名打开文件提示文件名太长怎么解决

这里分享一段python代码批量修改文件名字: import os,sys,re mydir=os.path.abspath(sys.argv[1]) os.chdir(mydir) cwd = os.getcwd() #group ID map id={"A79_A103_A104_A246_A356_A357_A375_A378_A379_A381_vs_A37_A409_A5_A48_A32_A221_A41_A241_A406_A408":"CW_vs_AW", "A11_A12_A13_A19_A20...

问题 老师,我想问一下,怎么将多个物种一起构建进化树。比如说构建向日葵,水稻玉米的nbs基因家组的进化树。

文章 IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践

...umor liver (N);通过单细胞测序共得到28,687 non-tumor liver cells4,414 primary tumor cells。通过Umap聚类分析得到28个clusters。 通过比较肿瘤样本非肿瘤样本的聚类结果发现,有些亚类细胞只肝癌细胞中出现(clusters 8, 13, 16, and 17),...

文章 饼图中添加文字的位置控制-ggplot2(非公式)

前面给大家讲过怎么去画饼图 https://www.omicsclass.com/article/376  也讲过堆叠柱状图 https://www.omicsclass.com/article/369  pie图讲解主要是针对图片中文字的添加位置公式进行了解释,这里结合堆叠柱状图内容 介绍不利用公式,而利用ge...

文章 blastlinux上的用法

...据库中搜索时所使用的核酸链 (strand),只对blastn、 blastxtblastx有效;1表示top,2表示bottom,3表示both;缺省值3 -T:产生HTML格式的输出I/F],缺省值F -n:使用MegaBlast搜索(T/F],缺省值F -G:打开一个gap的罚分 (0表示使用...

问题 进行进化树分析时,拟南芥与我的基因聚不到一起,是怎么回事呢?请求各位大神解答。

问题 已经发表的文章用的是两个隐马尔可夫模型,怎么样把搜索出来的数据合一起呢?

问题 我有几组16s扩增子数据分别为单端测序双端测序数据,是否能将其一起分析,可以的话要对数据怎么进行处理

文章 生信分析-小提琴图绘制-脚本使用

...组数据的分布状态以及概率密度,这种图表结合了箱线图密度图的特征,常用于生信分析中。 例如:2021年发表Briefings in Bioinformatics上的一篇影响因子为11.62的文献为例,该文献中大量运用了小提琴图来展示多组数据的分布...

文章 史上最有个性的论文盘点,你一定没见过!

...,平了我们科研汪身上的各种小脾气。。。大佬,您说怎么改,我就怎么改吧!所以,最后发表正式期刊上的论文,看起来才辣么严谨而又专业。。。。但是,总有一些牛人,能够顶住无数人的眼光层层的审核修改,发出...

问题 求教各位老师,做大麦基因家族分析构建系统进化树时,拟南芥家族成员分到了单独一支,大麦成员没法做比较。这种情况怎么解决呀

大麦鉴定出的成员拟南芥没法做比较,拟南芥拟南芥一起,大麦大麦分到了一起

文章 进化树构建方法及原理

...建进化树的构建。(3)序列比对为了保证序列的同源性所得系统发育关系的可靠性,需要对原始序列进行比对校正。自动比对序列的软件包括Clustalw 、MAFFT、MUSCLE等。(4)保守区用于构建进化树保守区选择是系统发育分析...

文章 sed使用

...容,而不是输出到标准输出(屏幕)。通常与模式字符串一起使用,以执行原地编辑。-i.bak: 与-i类似,但会创建原始文件的备份,备份文件的名称通常原始文件名后加上.bak。-r: 使sed使用扩展的正则表达式,默认情况下使用基...

文章 如何从GWAS结果中获取表型解释率PVE——TASSEL、GEMMA篇

...软件,也可以计算各种模型。接下来主要说明TASSELGEMMA怎么得到解释率 1.TASSEL TASSEL是可以直接得到pve值的,直接使用数据即可 1.1 GLM模型 marker_Rsq 即R2值,即表型解释率PVE 1.2 MLM模型及CMLM模型 MarkerR2 即R2值,即表型解...