文章 绘制类似于箱线图的散点图

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问题 重测序 htop 查看服务器使用

这个内存情况怎么看，怎么显示0个Runing? 

问题 基因家族成员鉴定

老师好，请问我研究的是玉米泛基因家族，学习了泛基因的课程。这个家族搜索不到pf号，只有拟南芥鉴定出来的20条序列，我用这20条序列构建了一个hmmer文件，后面应该怎么和blast结合，以及应该怎么查看结构域，感谢解答~

问题 老师您好！我想请教您关于土壤微生物分子网络构建的问题。我的实验材料是某一林地四个季节的土壤样本，每季节三个重复，三个重复样本能用conet构建网络吗？如果不可以，可以用四个季节的样本（12个样本）放一起做网络吗？这样合理吗（要怎么解释这个网络）？谢谢！

问题 根据转录组数据克隆功能基因

各位老师，我已经测了转录组，有拼接结果，我想克隆hsp70基因做原核表达，我应该怎么挑选序列，并且怎么判断序列是否完整

问题 基因家族成员，筛选差异表达基因

老师，您好！一般分析完某个基因家族成员后，对其进行验证，请问公开的转录组测序数据怎么找呢？从转录组数据中怎么找出差异表达基因？

问题 群体遗传PSMC问题

群体遗传课程57课PSMC那里，我看视频是一个.bam文件就能做一次分析，出一张图了。那我的数据有200多个样本400个bam文件怎么办呢？？需要合并吗？怎么合并啊？ 下面这个是例子代码：

问题 大家好！我想问下Fst&pi进行选择性消除分析后，得到的fst-pi.A-vs-B.selected.region.txt文件里的信息是A群体受选择的窗口还是A和B总的受选择的窗口？我怎么可以得到A或者B群体受选择的窗口啊

问题 老师，别人发的一篇泛基因组文章，应该是从头组装构建的，每个基因组对于参考基因组的SV，是不是用他们这个SV文件就可以合成图谱，就是一堆SV怎么搞成线性化，跟正常基因组一样的，作为一个参考基因组，这个是可行的吗，如何操作

问题 老师，别人发的一篇泛基因组文章，应该是从头组装构建的，每个基因组对于参考基因组的SV，是不是用他们这个SV文件就可以合成图谱，就是一堆SV怎么搞成线性化，跟正常基因组一样的，作为一个参考基因组，这个是可行的吗，如何操作

问题 老师，别人发的一篇泛基因组文章，应该是从头组装构建的，每个基因组对于参考基因组的SV，是不是用他们这个SV文件就可以合成图谱，就是一堆SV怎么搞成线性化，跟正常基因组一样的，作为一个参考基因组，这个是可行的吗，如何操作

文章 mirDeep2的使用

..., 记录每个样本的每个miRNA的count数，结果同样可以用网页打开查看 第四步：鉴定已知和未知的miRNA miRDeep2.pl Total_reads_collapsed.fa  Myzus_persicae_O_v2.0.scaffolds.fa Total_reads_collapsed_vs_genome.arf \   mature_ref_this_species.fa mature_ref_other_spe...

问题 WGCNA表型信息表

我有两个品种，和菌培养后，收集0小时对照，还有6和24小时的处理组，各三个重复。正好15样本。我的样品信息表应该怎么填。第一列是所有样本名字，第二列是他们对应的处理时间，第三列的不同品种应该怎么表示？

问题 基因组重测序使用qualimap 出现Exception in thread "main" java.awt.AWTError: Can't connect to X11 window server using 'localhost:18.0' as the value of the DISPLAY variable.

...还是不行，还是显示上面报错。 请老师们帮忙解答一下怎么解决！

文章 linux的简单命令（二）

...如：wqc、q #其中q表示退出，q!#表示强制退出 2：下载软件 wget +链接 3：cat命令 一次性显示整个文件的内容 cat+file.name+|+tac#表示事先在文件file.name中上下翻转cat+file.name+|+rev#左右反转，每一行的字符都镜像显示 4：查看文...