问题 LD分析相关问题

老师您好，关于这个问题（https://www.omicsclass.com/question/8454），我还有一点不太明白，想请教您一下。 LD.p.TriangleV （上图）文件初次看有些困惑，想请问这个文件每一行、每一列分别代表什么？另外，LD.p.TriangleV 中的每一行、...

问题 微生物16S分析物种功能预测PICRUSt2部分，进行代谢通路差异比较可视化

微生物16S分析物种功能预测PICRUSt2部分，进行代谢通路差异比较可视化时，如果是三组之间比较分析，这个代码应该怎么修改，谢谢老师！Rscript $scriptdir/ggpicrust2.r --daa_method $m  \     --pathway_table q2-picrust2_output/pathway_abundance.qza \ ...

问题 泛基因家族分析之Fam_gene.list

...基因组名字Yugu1_T2T.genome有误），但在家族成员存在缺失分析时，awk 'FNR>1{print $1"\t"$2"_"$3}' final.last.gene.pair.txt > foxtail_millet.pan-genes.list 整理格式时，已经均进行了调整（名字纠正），但经过perl /work/scripts/PAV_list.pl -pangene...

问题 TCGA分析得到的risk score如何用自己的数据进行验证，定量pcr可以吗？

通过学习TCGA生存分析课程，得到了几个基因的risk score，但现在我想用自己的样本进行验证，是不是必须测序，就用定量pcr可以验证吗，该怎么计算？

问题 购买的基因家族课程过期了，docker以及里面的基因家族分析包还是镜像，都不能用了吗？

请问老师，购买的基因家族课程过期了，docker以及里面的基因家族分析包还是镜像，都不能用了吗？

问题 老师，请问我在做基因组间共线性分析，我的gff 文件，和cds 文件格式如下，如何修改这两个脚本文件get _gene _bed.pl和get _fa _by _bed. pl ，才能提取成功进行下一步分析，谢谢！！

问题 基因表达差异分析是使用FPKM还是用readcounts来计算显著性？

问题 MCScanX分析中collinearity文件没有结果 其余都有 是什么原因呢

问题 运行出错，edgeR做差异分析，报错NA counts not allowed

问题 老师您好，请问家族蛋白基因多序列比较分析的研究思路是什么呢？

问题 老师，做共线性分析的时候，遇到下面这种情况，是需要什么脚本吗？

问题 我是你们客户，帐号13971529286，需要RNAseq转录组分析资料。请提供。谢谢

问题 老师，我们为什么要分析motif，motif是干什么的

问题 《代谢组学数据分析处理培训班》这个培训有回放么？

问题 基因家族扩张收缩分析中，怎么样才算是显著扩张和显著收缩？