老师您好,请问这个图的绘制信息在哪个文件,是06中的All.final.sv?下面的HP301就是对应的SUPP_VEC中的显示为1品系基因组吧。变异类型咋看是插入还是缺失呢?长度是两者之差?
根据p值获取关联区域中,为什么要用如下语句以合并P值 cat pvalue.bed region.bed |sort -k1,1 -k2,2n >all.region.bed 合并P值在获取关联区域的作用是什么,可否像之前录像讲的那样不用这个语句吗?
#############################relate modules to external clinical triats###################################### # Define numbers of genes and samples nGenes = ncol(datExpr0) nSamples = nrow(datExpr0) moduleTraitCor = cor(MEs, datTraits, use = "p") moduleTraitPvalue = corPvalueStudent(moduleTrai...
猪单细胞测序数据进行轨迹分析时,已经知道分化的起源,想请教老师这个代码应该怎么修改?Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle2.r -g mycelltype \ -i subset.T.rds -p monocle2 \ --order.gene.select.method monocle --heatmap.gene 20 \ --heatmap.clust...
...安排的学生没接接触过转录组,别说写文章,连公司给的分析结果都看不懂!几万块钱的实验费白白打了水漂。 转录组要是有“说明书”就好了 其实吧,这事也不能怪同学们,毕竟初次接触哪能短时间就懂了呢? 有过类似经...
...的文件走一遍流程,很顺利。 但是换成我自己的就运行不出来了,我有几个小问题,实在不太清楚,麻烦老师帮我解答: 1.fa文件需要这个物种的全基因组么? 2。indel的vcf文件怎么获得的?我有一个excel的文件,里面有indel位...
...常在网上冲浪, 那么你什么奇葩的事情都会见到, 这不,这两天,就有一个很奇葩的新闻, 事情是这样的: 华中科技大学某副教授万某, 在2009年6月获得了湖北大学教育学硕士学位, 这位教授当时的硕士学位论文题目...
...,所以就叫做R语言,R是一个功能强大、用途广泛的统计分析、绘图的语言和操作环境。 R语言是生信统计和绘图的首选 为生物统计而生的语言生物数据分析当中很多地方都需要用到统计分析,R的开发最初就是要解决生物统计方...
老师,您好,这是我运行的结果,我检查了运行的过程,发现过程中就没有tandem文件 这是得到的collinearity文件,缺少比对结果 所以想问一下,这是我运行错误还是就是没有共线性? 注:已检查gff文件和Blast文件里的基因名,...
老师您好,我投稿了一篇泛基因家族分析的文章。审稿人问了关于perl的问题。“Please provide the Perl packages or software modules used in the analyses.” 下面是我手稿中写的关于perl的内容: 1.在Linux操作系统中应用本地perl语言分析15个苹果...
...eme命令,设置请见图片,命令运行后就一直停在一个地方不动了,大概有2个多小时了,不知道怎么回事,跪求解答。