猪单细胞测序数据拟时序分析时已知细胞分化起源，怎么修改代码？

猪单细胞测序数据进行轨迹分析时，已经知道分化的起源，想请教老师这个代码应该怎么修改？Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle2.r -g mycelltype \

-i subset.T.rds -p monocle2 \

--order.gene.select.method monocle --heatmap.gene 20 \

--heatmap.clusters 4

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2024-07-10 09:12

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

使用 5版本的镜像，可以运行monocle2：single-cell-v5.0.tar.gz

并且已经更新绘制热图；

代码已经更新,需要重新下载：https://bdtcd.xetlk.com/s/4i88K6