老师们好。我想做一下基于基因组来计算DNA-DNA hybridization (DDH), Average Nucleotide Identity (ANI), Average Amino Acid Identity (AAI)分析,但是要使用的俩个软件(Jspecies和CompareM)不太会弄,有没有哪位老师做过,谢谢!Q:1870871361
我所用数据是在组学大讲堂课程中参考数据的基础上,把自己数据粘贴进去。随后按步骤操作时,软件conet总是报错,无法构建OTU网络图。报错图片我已上传,恳请老师相助。
...,虚拟机的bio-linux自带不需要安装,就是gffread: 命令行格式:gffread gff文件 -T -o gtf文件,这里比较容易出错的就是大写T,小写o!
...想手动生成{ind}.domain_final.bed也不行了,这个问题还可以怎么解决么,卡在这里半个月了
两组共6个样本,上千个差异lncRNA 、mRNA,表中数据是RPKM值,如何用R语言做lncRNA-mRNA皮尔森相关性分析?cor函数输入文件是什么格式?
万分希望您能回答以下