问题 动植物基因组组装课，脚本文件中sed命令的含义

注释部分，01.Repeat.sh脚本文件84行： #修改分类名字 sed -i '/>/s$\s.*$#DNA/MITE$' MITE.lib 这里sed是用了替换的功能吗？sed替换的格式：sed 's/原字符串/替换字符串/'，这句命令的s后面没有“/”。

问题 老师好，在基因家族分析circos制图时，老师的文件是拟南芥的5条染色体，我的物种有9条染色体，请问这个文件需要怎么修改？

circos最后一步绘图的config2.txt文件，我的染色体是C01开头。图中我已经把拟南芥的1.2.3.4.5改为C01.C02.C03.C04.C05(括号内）。还需要重新添加C06-C09吗？不添加的话，最后结果文件中6-9号染色体都是灰色的，并且没找到我的目标基因id...

文章 神论文！浙大博士写130页论文，教大家怎样挑西瓜....

夏天怎么能没有西瓜？作为吃瓜大国的吃瓜群众，学霸姐姐也经常被挑西瓜这个技术活儿难倒，有人说要敲一下，听声音，清音、浊音、鼓音、实音、过清音......头头是道！还是饶了我吧，真心听不出来;还有人说，要看西瓜的...

问题 在基因家族分析的时候对GFF文件中mRNA与gene ID对应关系的脚本进行运行时出现如下无效的问题，请问怎么解决

运行命令perl script/mRNAid_to_geneid.pl data/Brapa_genome_v3.0_genes.gff3 BrapamRNA2geneID.txt perl script/geneid2mRNAid.pl data/Brapa_genome_v3.0_genes.gff3 Brapageneid2mRNAid.txt； 该两条脚本在对其它基因组进行运行时没有问题 但是在运行该GFF文件时出现了如下...

问题 《微生物多样性数据分析实操》课程资料的下载

已经购买了《微生物多样性数据分析实操》课程。该课程相关的数据、脚本等资料有链接可以下载吗？我没有使用docker软件，所以咨询有没有下载地址，谢谢！

问题 dadi

...面计算出的基因流时间都有个置信区间，我想知道用这个软件计算出的值在哪能找到置信区间。（例如， 文献里面的内容如下：The asymmetric gene flow scenario M8 was best supported by the 14 tested models (Figs. 2A, S1), with a log‐likelihood of 141.756 ...

文章 分享转录组学与新一代高通量测序PPT讲义

...例了解、认识第二代测序仪产 生的生物数据常见的存储格式 2、通过实例了解转录组和miRNA的数据 分析思路及常用方法 • RNA-seq Transcriptome Technology • RNA-seq Data Format • RNA-seq Data Analysis Strategy • Case Report

问题 请问如何预测基因家族蛋白的二级结构？

...，我看参考文献中讲的是根据基因结构决定的，我想知道怎么预测他们保守结构域的结构？ 另外，核定位信号怎么预测？ 再问一个和这个无关的问题，新版的参考基因组和旧版的基因ID表达方式不一样了，请问新旧版的ID怎么...

问题 请问在提取对大豆进行共线性分析，在提取一条大豆转录本的cds时候脚本怎么修改，大豆转录本没有.1或者.2用的是组学大讲堂基因家族分析课程的的提供的脚本

问题 请问，首次使用MCscan (Python version)可视化作图时，没有mcscan_seqids和mcscan_layout文件，该怎么创建这两个配置文件呢？自己创建的配置文件运行后，结果文件有问题

问题 您好，三代全长转录组无参测序，昆虫前后2次取样，第2次雄昆虫测的数据量是第一次雌昆虫的2倍，最后得到转录本是第1次的2倍。这个结果怎么解释啊？

问题 在构建进化树的时候，发现分组与拟南芥中的不同，比如A4分组被分开了，请问有什么解决方法吗？老师我看到了这个问题您回答说调整多序列比对结果，具体是怎么调整呢？

问题 老师，我做PAV分析时，“提取物种间泛基因编号相同的基因为同一基因”，这一步时产生的“maize.PHYgene.pan-genes.list”，只有几个基因，其他文件都正常，这是怎么回事

问题 lncRNA测序，如何把四种RNA分离，或者只提取mRNA

老师，我的样本测的是lncRNA测序，但是下游只想分析mRNA，请问有没有什么软件可以把mRNA、lncRNA、circRNA分开，或者只把mRNA提取出来，用于后续分析？

问题 我想问一下，根据这段代码，我每个样要跑10个小时左右，总共270份样，怎么优化这个代码，减少所需时间

for i in S1A ; do > > echo "RUN CMD: gatk --java-options '-Xmx20g' HaplotypeCaller -R $REF \ > -I $workdir/3.map/result/${i}.sorted.dedup.bam \ > -O ${i}.g.vcf.gz --max-alternate-alleles 4 --sample-ploidy 2 \ > -ERC GVCF --tmp-dir $tmpdir" > > gatk --java-op...