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文章 如何预测CpG岛

...序列片段的大小。通常设置为默认值或根据需要调整。 结果文件会生成如下所示的gff文件,记录所有预测的CpG岛位置信息: ##gff-version 3##sequence-region Gbar_A01 1 115039178#!Date 2024-05-17#!Type DNA#!Source-version EMBOSS 6.5.7.0Gbar_A01   ...

文章 COX 生存分析模型

...。 基本原理 生存分析的主要目的在于研究变量X与观察结果即生存函数(累积生存率)  之间的关系。 当  受很多因素影响,即                                  为向量时,传统的方法是考虑回归方程——即...

文章 Science乌龙论文:不好意思,作者把狗狗左右脑弄反了.....

...etraction) 当研究因为不端行为、造假或是诚实的错误导致结果不可信,也就是论文的结论无效时,就会撤稿。 学霸姐姐建议: 如果你发现自己已经发布的论文有问题,最好是如实说明, 不管是大错还是小错, 不管是你想改...

文章 心塞!比利时天才儿童9岁就读博,而有人读博15年还毕不了业......

...低, 每一个成年人自己做出的选择,都应该自己去承担结果。 希望各位儿童们以及超龄儿童们都能顺利毕业! 生物女学霸,一个自称学霸其实很渣的生物汪,努力将有趣的、有用的、有血有肉的科研那些事儿呈现给大家,...

文章 空间转录组数据挖掘流程记录-甲状腺癌(GSE250521)

...geom 18 \ -p Thyroid_sct_PT-1 -o sct_PT-1 --cluster_banksy 结果展示: 空间转录组分析课程推荐:https://bdtcd.xetlk.com/s/2Xg4ac

文章 已知集合交集数量绘制韦恩图

...的数量,也就是不让R包去进行这个计算过程,直接根据结果绘图。大部分R包无法直接根据已知的交集数量绘制 Venn 图,必须依赖提供的集合元素列表进行计算,但是少部分R包可以,比如VennDiagram包,VennDiagram还给我们提供了另...

文章 Molecular Plant | 一个接近完整的拟南芥基因组组装

...发现了145个隐藏的重复基因。同时通过从头预测,同源性搜索和转录组组装三种方法在新序列上得到了68个基因。此外在基因组上一共识别到35M的重复序列,又利用LASTZ得到着丝粒特征重复CEN 180的集合,构成特异性motif文库,确...

文章 2020考研340万人:研究生毕业这么难,你们为啥还要考研?

...,专心考试,专心读就好了, 只要努力过,一切都会有结果。 考研人们,加油! 生物女学霸,一个自称学霸其实很渣的生物汪,努力将有趣的、有用的、有血有肉的科研那些事儿呈现给大家,关注一个好不啦~

文章 ssh-keygen和ssh-copy-id实现免密登录远程主机

...就好比我要去朋友家,我先将我们家的钥匙放在朋友家,结果我就可以随便进入朋友家里。正常来说,我家钥匙在朋友家里,应该是朋友随便进入我家。通过实验我们来看是什么样的。 这里假定我们需要在node01上远程登录node02...

文章 geo_gene_exp_download.r GEO数据自动下载与整理

...a_geo/scripts/geo_gene_exp_download.r -g GSE43488 -G GPL13667-15572.txt 结果输出: 数据整理说明 探针与基因对应: 1.一个基因对应多个探针: 取均值,最大值,等 2.一个探针多个基因,取第一个基因名字 表达量是否需要重新标准化...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

...e \ --vars.to.regress nUMI percent_mito --high.variable.genes 2000 结果展示: 单细胞转录组分析课程推荐:https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE178341)

...8341 --resolution 0.5 -d 30 -o 02.cluster \ --high.variable.genes 2000结果展示:单细胞转录组分析课程推荐:https://bdtcd.xetslk.com/s/4i88K6

文章 基因家族的定义和形成方式(加倍与扩张)

...了,周围的其他基因不相似。所以blast分析与mcscan分析的结果有区别也是正常,下面的基因家族课程中我们有将实际操作方法:基因家族分析学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读另外,串联重复基因 tandem和se...

问题 作共线性分析的时候,用水稻的bed文件,无法获得水稻的cds,是不是因为水稻的cds.fa文件内是os08t0254300-00,而不像拟南芥的at012358.1这样后缀不一样,所有无法过去它的cds

...t;close(); 输入文件为:Oryza_sativa.IRGSP-1.0.cds.all.fa 和os.bed 结果:无法获得os的CDS序列

文章 基因编辑RAW264.7细胞系—助力炎症以及破骨细胞生成相关研究-源井生物

...回GKO克隆,研究者能够重新引入miR-155效应。总之,这些结果表明,内源性miR-155基因的突变可能导致pre-miR-155产物被截断,无法成熟为更短但稳定的miR-155。 通过CRISPR/Cas9技术将GFP敲入Raw264.7细胞,靶向NLRP3炎性小体,探究改善炎...