前段时间对80个样品，20000个基因进行WGCNA分析，可以顺利分析；最近对34个样品，14000个基因进行分析时，在计算TOM值时总出现“cannot allocate vector of size 1.6GB.”这是为什么呢？样品数和基因数变少却无法计算。（实验室服务器64...
...组结果，知其然更要知其所以然； 二是自己掌握基础的分析技巧，打通从结果到文章的最后一步！ 为此，组学大讲堂（专业生信教程制作团队，学员已超25000人），基于主流测序公司交付的转录组标准分析结果进行了全面的解...
...死亡是任何原因导致的死亡都算进去，只关心是否死亡，不关心因为何种原因死亡。 2.disease specific survival Overall Survival：DSS 疾病特异性生存期，结局指标改变为 “由特定疾病导致的死亡”，这时候开始关心死亡的原因是否是由...
如何获取基因功能参考数据，如何导入进行富集
...判断他第一列的内容是否在上一个文件中存在，结果总是不存在，然而明明就在啊，怎么会不存在呢，一遍遍检查代码也找不到问题。到底为什么呢？ chr01 1 00 ... ...chr02 1 00 ... ... 后来经过排查发...
老师，您好。请问一下：分析基因的选择压力时，Ka或Ks等于一方或双方都为0时，要怎么分析呢？
...全管理器已经被标记为过时（deprecated），并且在未来的版本中将被移除。这个异常提示是因为你的代码或者依赖的库试图设置或使用安全管理器，而这在最新的 Java 环境中不再被支持 解决这个问题的简单办法是在执行前将自...
...d.table("Volcano.txt", header=TRUE,sep = "\t") 数据格式如下（表头不要改）： ID FDR log2FC sign Trans_newGene_1010 0.1719571 -0.327617885 NA Trans_newGene_1013 9.65812E-10 -0.905601526 NA Trans_newGene_1014 0.268121627 0.212668419 NA Trans_newGene_1026 0.361458835 -0.371...
想学习一些分析DNA进化，起源、适应、synteny， 插入、重排、掉失、获得、二倍化、基因转录方向、排列顺序、启动子活性等的分析软件，但不知都涉及哪些软件，还望指点！有赏金！
老师，请问我在进行疾病与正常对照的微生态群落分析，在环境因子中无法设置连续变量值，是否可填入0、1进行分组分析呢？或者应该如何进行这类的网络分析？
在此之前已经通过grep -v -E "^##|^Contig"过滤掉以##和Contig开头的行了，染色体名字也从LG01转变成1了