问题 QTL定位时像小麦染色体为chr1A-7A,chr1B-7B,chr1D-7D,代码应该怎么修改？

问题 老师，我想问一下Evolview美化导入进化树的时候，它自动把bootstrap值低的分支给砍了，怎么设置可以保存原本的树，再进行美化呢？

就是，bootstrap值低的分支，直接变成一条直线了，怎样设置，才能改变这种情况啊。

问题 老师，使用非ensemble数据库的蛋白质序列和基因组染色体fasta文件脚本要怎么进行修改呢？

最近在做油菜相关基因家族的相关工作，ensemble数据库里的pep和toplevel文件下载之后解压总是提示unexpected end of file, 就从其他数据库下载了pep和toplevel的文件， 在除重复的hmmer搜索的转录本ID，多个转录本ID保留一个作为基因的...

问题 LTR注释结果

...组学的课程，自己用LTR_Finder，LTRharvest，LTR_retriever这三款软件对LTR进行注释，最后在.LTRlib.fa 文件的结果显示的LTR序列总长才23Mb。23Mb和公司注释出来的4Gb也相差太大了吧，，况且一个9G的基因组，LTR也不太可能只有23Mb吧。这其...

问题 老师您好！用meme分析motif时显示zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决这个问题呢？谢谢

...zsh：no such file or directory:/biosoft/meme/meme-v4.12.0/bin/meme。该怎么解决这个问题呢？谢谢

问题 老师，我是下载的最新版本的biolinux，但是在做不同物种之间的共线性分析比对时，最后出结果出图的时候出现这个了，请问怎么解决啊？

输入的命令为：/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7。

问题 在SNPcalling结束后进行合并gvcf文件的时候发现文件里只有双亲的信心，核查发现两个子代的gvcf文件的表头中两个池的名字都是感亲的名字这个怎么修改

...代的gvcf文件的表头中两个池的名字都是感亲的名字这个怎么修改？或者是哪里出现了问题？ 四个文件并不一样大小 感病亲本 子代感池，名称那一栏，子代的名字变为了Sparent 子代抗池，里面抗池名称那一栏变为了Spar...

问题 你好，我想将GFF 文件里面ID中一些不必要的信息删除，请问应该怎么写命令呢？这个物种gff文件比拟南芥的gff文件要复杂的多

问题 如果没有pfam号，文献中只有conserved domain号，如cd00325，怎么下载（如pfam的那样的文件）这个保守结构域的序列？（如pfam的那样的文件）

问题 黄老师，我已获得BSA流程过滤后的snp的vcf文件，然后怎么利用这个文件绘制全部染色体的SNP-index的曼哈顿图

问题 最近用新生成的hmm文件做hmmsearch 报 TC bit thresholds unavailable的错，看您留言说已经解决了，请问您是怎么解决的呢？望您解惑，谢谢。

问题 老师，您好，我按照课上讲的方法去构建进化树出现了如下图所示的错误，该怎么去解决呢，我把这一行删除了但还是显示有问题

问题 菌株做全基因组测序，组装结果为150Mb，但是参考基因组大小为66Mb，样品也没有污染，请问这样的结果符合常理吗？应该怎么应对这种情况？

问题 请问，用Evolview为树枝染色时，如果一个添加多个，只有第一个被染色，除非换行。怎么像教程里使用“mouse,human blue”一次染色多个不挨着的树枝呢

问题 老师，我做基因家族基因结构变异信息时，只有8条结果，这个结果还能继续往下做么？我又做了一个家族，有70多条变异信息，这个结果怎么样