文章 R was not built as a library python 中 rpy2 报错

...e-R-shlib 选项，将R编译成lib模式！ 因此，我重新下载最新版本的R 3.4.2并编译安装：./configure --prefix=<YOUR_R_HOME> --enable-BLAS-shlib --with-blas --with-lapackmake && make install 最重要的是如果R安装到个人路径下，记得添加环境变量：...

问题 老师我做比较基因组的时候，准备文件阶段时用Ensembl 下载的基因组为什么跑不出来cds和蛋白质文件，跑出来的结果都是0kb，wsl内存也设置了，麻烦老师您再看一下

01.prepare_data.sh.o

问题 做两个组中共线性分析时，两个物种分开做种内共线性分析可以跑出来，做种间却不行，是为什呀，

两个物种的GFF文件合并有什么特殊的要求么，与做种内共线性分析有啥不同

问题 老师，请问一下我在进行WGCNA分析时，将原始数据的基因顺序打乱后，分析得到的关键基因就变了，请问一下这是怎么回事啊？

老师，请问一下我在进行WGCNA分析时，将原始数据的基因位置改变之后，分析得到的关键基因就变了，请问一下这是怎么回事啊？

问题 老师，您好，我在做wgcna分析时，灰色模块内的基因数量过多，这对我后续的分析有影响吗

问题 有关于GSEA富集分析参数设置

老师，在做GSEA富集分析的时候默认参数没有富集到基因，查阅相关资料，可以通过改变参数富集到基因，但是有关于参数设置的合理性和后期实验验证的可能性，还是有疑问具体想请教：老师，想请教一个有关于富集分析的问...

问题 WGCNA分析进行模块和性状相关性分析时，trait文件如何做？

WGCNA分析进行模块和性状相关性分析时，trait文件如何做？ 例如以下面paper中的图为例 实验设计是：选取了两个大豆品种做转录组分析，分别是：大籽粒Wandou 28 (V1)，小籽粒Peixian Layanghuang (V2)，取样时期为三个时期：seed set (S1), ...

问题 请问一下，就做了一个转录组测序，样本是不同的组织，能否用WGCNA分析分析，写个文章？

这里的组织相当于指的是根茎叶花，花瓣，纤维，胚珠等22个组织，没有其他处理。

文章 采用差异表达基因进行WGCNA分析是不合理的

...学员参考一些低分的文章，选择差异表达的基因进行WGNCA分析，那是非常不合理的。官方FAQ中也特地强调了这一点。 再次强调一下，不要看见别人用差异表达基因，就认为那是合理的，而忽略了WGCNA分析原理。 如果你想学习WG...

文章 tar压缩解压缩命令详解

...tar包中所有文件，-x是解开的意思查看tar -tf aaa.tar.gz   在不解压的情况下查看压缩包的内容压缩tar –cvf jpg.tar *.jpg //将目录里所有jpg文件打包成tar.jpgtar –czf jpg.tar.gz *.jpg //将目录里所有jpg文件打包成jpg.tar后，并且将其用gzip压缩...

问题 GO富集分析

请问一下在做GO富集分析的时候，标记的这里的gene ID怎么才能显示用于分析的gene ID啊，这样我才能知道那些基因对应那个GO term啊，谢谢！

问题 老师，请问串联重复基因由cds blast得到，而共线性分析由mcscan比对pep序列得到，请问一下这两个什么区别，为什么共线性分析我的基因家族（180个基因）只有一半染色体有共线性，是不是哪里分析出错了

mcscan分析蛋白序列得到circose blast得到串联重复基因

问题 老师您好，我想请问一下，通过分析找到的基因家族成员在NCBI上都是预测基因，继续分析没有问题吗

问题 做基因家族分析时，用MCScan做共线性分析，跟着教程走没有发现有串联重复的基因，这种结果正常吗？

问题 老师您好，我想问一个问题：这个python打印星号金字塔的过程中，如果i指星号数量，那么在金字塔中i的最大值为9啊。而且我不明白j的意义。这些问题我不太明白，请老师解答。谢谢老师