问题 顺势作用元件分析

你好，请问上游顺势作用元件分析时，基因位于支架上，不在染色体上，做顺势作用元件分析还有意义吗？

问题 数据分析

通过GEO数据库和TCGA数据库分析得到的关于同种癌症的差异表达基因，能不能通过韦恩图将两个差异基因数据合并寻找交集进行分析？

问题 GO分析结果的如何挑选有用信息

...解读的时候，差异基因是通过采用不同的参考基因组进行分析的，最终选择了差异较大的17个基因（不同基因组均有涉及的）进行验证，那GO分析的时候是利用差异基因进行分析，如果采用不同的参考基因组，GO的结果应该是受到...

问题 有参转录组测序分析，各个样品的数据与参考基因组的比对效率多高才能够满足后续分析？

问题 用docker分析不同物种间共线性分析图片中染色体图片出现缺失，这个该怎么修改

问题 这里的hmmer分析用的是两个结构，也就是两个pfam号，那要怎么分析两个呢

文章 细胞培养中的胎牛血清正确使用指南

...细胞同时，也极有可能因为一时的疏忽和大意选择了品质不好的血清，导致珍贵的细胞意外身外，一切归零，不得不重头开始! 血清质量的差异性大 市场上各种血清产品鱼龙混珠，一不小心，你可能就使用了品质不好的血清。 ...

文章 bioperl处理fasta和fastq序列截取反向互补翻译等等

...gt;"ID1"); # part of the sequence as a string my$subseq=$seqobj->subseq(5,10); print $subseq."\n";my $newSeqobj = Bio::Seq->new(-seq => $subseq,       -desc => 'subseq 5-10',       -id =>"ID2", );$out->write_seq($newSeqobj);trunc和subseq有区别，trunc返回还是原...

问题 转录组数据分析

作为一个小白，怎样零基础开始学习转录组的数据分析，能针对不同的数据合理分析。

问题 用deseq_analysis.r分析差异表达分析时报如下的错误

[1] "abstract_factors is start" Error in scan(file = file, what = what, sep = sep, quote = quote, dec = dec,  :   line 2 did not have 3 elements Calls: abstract_factors -> read.table -> scan Execution halted

问题 基因的共线性分析

最近在做基因的共线性分析，由于该领域知识匮乏！急需大神的指点和帮助！ 我现在的情况是这样的： 1、我目前有9条不同基因序列（来自不同物种的同源序列） 2、我想要分析一下这几条基因序列之间的共线性关系 问题是： 1...

文章 muscle新版，旧版使用的一些差别

...出文件 即：muscle  -in in.fa -out  out.fa 2.新版以muscle 5.1版为例：muscle -align input.fa -output aln.afa -align 后接输入文件 -output 后接输出文件 3.如果序列多，可改为： muscle -super5 input.fa -output aln.afa 4.SEED是其隐马尔可夫模型（HMM...

问题 两个不同的基因家族可以分析蛋白互作吗？做些什么分析能把两个基因家族联系起来呢？

1、两个不同基因家族已经分别做完全基因组分析了，接下来可以做些什么把两个基因家族联系起来呢？请各位有经验的朋友给点建议，谢谢大家 2、打算做两个家族的蛋白互作分析，请问可行吗，有视频教程可以购买吗？ 3、...

问题 串联重复基因分析

老师，在进行共线性分析时，基因加倍与串联重复分析，得到如图结果，我没发现有串联重复基因，全部都是片段重复基因，这样的结果对吗

问题 请问大家，我现在用linux虚拟机4G进行rna-seq是不是内存不太够要求呢？我现在学习到了hisat2比对的环节，但是log文件显示这样的信息，sam文件是0字节，有点摸不着头脑。