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文章 python特殊属性和方法的详解与运用

...法, __dir__() 方法将非常有用。通常,调用 dir(x) 将只显示正常的属性和方法。如果 __getattr()__方法动态处理color 属性,dir(x) 将不会将 color 列为可用属性。可通过覆盖 __dir__() 方法允许将color 列为可用属性,对于想使用...

文章 DEG_limma.R 差异基因分析limma

...tsv -t subtype.hclust \ > --case S1 --control S2 -p S1_vs_S2.limma 结果展示:火山图:

文章 蛋白表达的影响因素及规避方法?

...稀有密码子来提高重组蛋白的表达可能会起到适得其反的结果。   5、mRNA二级结构 mRNA如果形成大而稳定的二级结构如发卡结构和茎环结构,尤其是起始密码子附近的稳定二级结构,将会影响mRNA在翻译过程中核糖体的结合和延...

文章 总结:组织芯片在肿瘤研究中的应用及制备步骤

...织标本在基因组、转录组、蛋白质组甚至细胞水平的检测结果。 组织芯片的优劣势 组织芯片相对于传统的组织切片优势十分明显,规模大、通量高、标准化,组织芯片上的组织样本实验条件完全一致,有极好的质量控制,同...

文章 在R里绘制地图

...r_palette)+  guides(color=FALSE)+  xlab('Longitude')+ylab('Latitude') 2 结果 maps maps 包是 R 语言中用于绘制地图的一个基础包,它提供了简单的地图数据和绘图功能,适合用于绘制静态地图。 1 简单绘图 绘制世界地图: map("world", fill = TR...

文章 rbsurv对生存分析的单因素进行鲁棒性检验

...0, n.iter = 10,n.fold = 3,gene.ID =row.names(rust_test)) # 鲁棒性分析结果 > fit$model Seq Order Gene nloglik AIC Selected 0 1 0 0 269.17 538.35 110 1 1 AC092614.2 261.86 525.71 * 2 1 2 RP11_415F23.3 256.66 517.32...

文章 qiime2 couldn't connect to display "localhost:12.0"

...物扩增子分析课程实操     微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读

文章 Infercnv|单细胞转录组拷贝数分析

...infercnv.r -i data/cnv/merged.rds --downsample 100 -g 0 1 2 -o cnv_result 结果展示: 输入文件准备:本脚本所必需的输入文件只有一个,即经聚类注释后的seurat对象,为rds文件。 更多脚本参数设置及说明,通过-h参数获得以下帮助信息: us...

文章 R语言数据筛选整理包dplyr 分类汇总

...all_vars(.>150)) %>% head() # 筛选所有变量均大于150的行,结果为空 mtcars %>% filter_all(any_vars(.>150)) %>% head() # 筛选存在变量大于150的行, # 针对变量名称为d开头的所有列,筛选存在变量能整除2的所有行 mtcars %>% filter_at(vars...

文章 317名研究生被退学?多半是自己作的

...原因被退学、被结业的人,绝大部分真的只是自己作死的结果。 踏踏实实,做好一个学生该做的事,读研期间在学校尽情成长,毕业没那么难~ 希望大家都能如愿考上研究生,也都能顺利毕业! 生物女学霸,一个自称学霸其...

文章 本科生到底要不要进实验室?怎么进实验室?

...在实验室一点一滴地强化你文献查找、阅读、课题设计和结果分析等软实力, 可能学会做一个实验很容易,但是收获科研果实并没有那么容易, 除了好好学习技能之外,你还需要好好考虑清楚,自己在今后能否承受这种巨大...

文章 一抗二抗怎么选?义翘神州来教你

...xpasy和NCBI BLAST来进行不同物种蛋白同源性比对。如果比对结果证明同源性较高,也是可以考虑测试下。   (2)确定实验类型   确定自己的实验类型,如ELISA、WB、IHC、IP、FC等,选择包含该应用的抗体。一般抗体说明书会列出...

文章 2019国自然解读:关于CRISPR/Cas9的项目数据怎么样?

...16日,大家翘首以盼的2019年度国家自然科学基金项目评审结果揭开面纱,共有41752个项目获得资助,总金额高达213亿元,可谓是历年之最。 而这其中,生命科学部获批资助6478项(不含杰出青年基金项目),批准资助金额共计32.71亿...

文章 merge_metadata_genexpdata.r 在metadata中添加基因表达数据

使用说明: metadata添加基因表达结果。 基因表达文件行为不同基因,列为不同样本, 只要是列为不同样本的文件都可以用这个脚本合并到metadata中; $Rscript $scriptdir/merge_metadata_genexpdata.r -husage: /share/nas1/huangls/test/TCGA_immu/scripts...

文章 multi_cox.r 基因表达量做多因素cox分析

...A414-3128911.0623410.7520182.3805134.4158150.5181420.2121971.2392030.582114结果展示: 预后模型构建: The Risk score was calculated with the following formula: The  risk score= , where Expri represents the expression level of gene i and coefi represents the regression coefficient ...