话题 单细胞转录组数分析

话题 单细胞转录组 细胞通讯分析

话题 单细胞转录组 拟时序分析

问题 NCBI下载基因组文件作基因家族分析

从NCBI数据库下载的基因组文件作基因家族分析和Ensembl下载的文件有哪些区别，需要怎么转换文件，gff和gff3文件差异还是挺大，

问题 PSMC分析

请问老师，同一批处理的数据，16个地理种LNSY.pdf群，只有两个种群的结果正常，其他都是一条直线，检查bam文件也是正常的。这是什么原因呢？

问题 不同物种之间的共线性分析，出现问题，望解答、谢谢

老师，上边的前九组那么短，麻烦您给分析下是哪个文件出问题了

问题 Deseq分析差异表达基因时，我按照转录组自主分析课上教的方式运行，一直出现Error in `[.data.frame`(ori_data, , as.vector(f_mat[, 1]))，导致无法进行。想请教一下，如何解决这个情况。

Deseq分析差异表达基因时，我按照转录组自主分析课上教的方式运行，一直出现Error in `[.data.frame`(ori_data, , as.vector(f_mat[, 1]))，导致无法进行。想请教一下，如何解决这个情况。

问题 泛基因家族分析

老师，我在gbff转gff文件的时候，遇到报错，这个该如何解决。用的就是“bp_genbank2gff3.pl”这个脚本

问题 老师您好，我是刚接触生物网络分析的小白，在我做otu table 共存网络分析时出现下面这种情况：

我在R中运行如下代码： Abu=read.table('family_nor.out',header=T)Abu<-as.matrix(Abu)#Min support filtering for each taxaAbu[Abu<0.01]<-0#Filter taxa by abundance sumAbu<-Abu[which(rowSums(Abu)>10),]#Filter taxa by Occupancytable<-Abutable[table>0]<-1table1<-Abu[wh...

问题 请问老师们有关基因家族分析有利用较大数量物种（例如50种以上）研究某一家族基因的案例吗？

老师，您好！ 考虑到大数据分析具有量变引起质变的本质，目前基因家族分析普遍集中于一种或几种物种上，那试问如果把基因家族分析扩大到较大数量物种（例如50种以上），是不是效果会更好一些，更具创新性一些，有这...

问题 请问老师们有关基因家族分析有利用较大数量物种（例如50种以上）研究某一家族基因的案例吗？

老师，您好！ 考虑到大数据分析具有量变引起质变的本质，目前基因家族分析普遍集中于一种或几种物种上，那试问如果把基因家族分析扩大到较大数量物种（例如50种以上），是不是效果会更好一些，更具创新性一些，有这...

问题 使用GSDS来可视化基因的顺势作用元件，发现有些元件显示不出来。只能修改那些元件颜色和形状，不能移动元件标识。用那个GSDS自带的edit功能，进去之后之前修改的元件形状又变成修改之前的样子，edit只能移动不会修改元件颜色和形状，也不会保存到本地。请老师给想个办法？

问题 玉米单个基因与性状的分析

...系的材料，可以测定其基因序列和对应的数量性状，如何分析是基因中的哪些SNP导致了性状的差异。要挖掘该基因的优良等位变异后续研究应该怎么做，请简述方法并附相应的文献（有文献标题或者链接即可）

文章 520又又又到了，为啥科研汪不容易找对象？

...，花见花开，男粉丝也有一大把，但依然是只单身汪， 不过，在今天，热心肠的学霸姐姐还是决定，一边吃着柠檬， 一边贴心地为广大脱单了的、或者即将要脱单的科研小伙伴们总结一些520硬核表白指南(没错，没人约，学霸...

文章 寿命表法计算中位生存期

生存分析中，一般以中位生存期的显著差异作为一个影响因素重要性的判断标准。 一般拿到生存数据之后，可以基于生存状态，和生存时间进行KM分析，获取中位生存时间。 比如下面的生存分析表（部分截图）： 可以采用...