问题 circos圈图参数——热图

请问画圈图时，用热图表示，用颜色的深浅来表示数值的大小，这个要怎么设置，图例要怎么设置。还有怎么改变其中一个圈的宽度

问题 docker镜像加速后，下载你们的gwas镜像时，总是pull了一半，剩下的立刻就没反应了，尝试了几十次，这个怎么回事，

你们这个镜像难道不可以搞小一点吗，分几次下载也行，一个镜像里面涵盖这么多的子项，一下载就出问题，每次都是下载一半成功，然后突然就停止了，后边一半根本没有任何反应，请求速答

问题 ssr引物设计

老师.你好，请问一下，那个SSR引物设计，如果根据1号染色体中的一段序列来设计引物，这个命令应该怎么输？ 例如，就是怎么截取该1号染色体中365-1200这段 前1000行序列用head.中间的怎么截

问题 bio-linux ova包在百度网盘的pan.baidu.com/s/1bMOLEu这个地址已经没有了？怎么办？如何找到bio-linux ova包？

 我看组学大讲堂“Linux生信分析环境搭建”一节里，安装bio-linux需要它的ova包，可是提供的下载bio-linux ova包的百度网盘地址：pan.baidu.com/s/1bMOLEu，已经不存在这个资源文件了，怎么办？求解决办法。

文章 STRING蛋白互作网络图绘制及子网络分析

...点参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节，能够系统分析大量基因在生物系统中的相互作用关系，对了解生物系统中各个成分的工作原理，了解疾病等特殊生理状态下生物信号...

问题 T2T基因组调研图中jellyfish -h和genomescope.R -m 都是设置的10000000，设置的依据是什么，不同作物有差异，怎么选择参数呢

... 和genomescope.R -m教程中设置的1000000，不同物种有差异吗，怎么选择呢？ jellyfish histo -v -t 4 -h 10000000 -o illu.histo illu# histo输出k-mer频率直方图数据，统计出现了x(x=1,2,3…)次的kmer的数目y# -v 输出详细信息# -h 最高计数值genomescope.R -i i...

问题 基因组信息

继续上一个IDlist基因组信息，这个基因组我该怎么删怎么改，scaffold和chr不同，但基因组心里的等同于染色体位置信息，我该怎么删减，这是苹果山定子基因组？麻烦看一下，这个有点复杂

问题 请问如何升级虚拟机系统里的Python3?

您好，之前参加过贵公司组织的基因家族培训班，其中用的虚拟机，现在需要安装软件，发现python版本低，有什么办法升级？ 期待您的回复，谢谢！

问题 如果利用基因来批量提取一批基因的蛋白序列，结果提取的结构域文件中，发现并不是全部的基因都提取出了序列，那么怎么查找或者说获取这些没有提取到序列的基因是那些

我在利用以下脚本提取基因文件对应的蛋白序列的时候，提取后对这个蛋白文件进行结构域确认的时候，发现蛋白文件中只有328/392个序列，想获得哪些基因没有提取到序列，怎么找到这些基因呢？

问题 rna-seq数据质量控制

...的FASTQC质检报告，tile质量有warning，但是考虑到已经使用软件过滤掉了低质量的reads，这一项是否可以不做处理？另外overrepresented sequence也有warning，考虑到是rna-seq数据，是否可以忽略不计？

问题 如何将不同样品SNP整合及过滤？

...件，然后再过滤？这种整合需要自己写脚本还是用vcftools软件可以完成？

问题 基因组注释的镜像是否更新过？

重复序列注释中LTR_retriever -genome contig.fa -inharvest contig.fa.rawLTR.scn -threads ${threads}这一步产生的文件名由contig.fa.LTRlib.fa变成了contig.fa.mod.LTRlib.fa，请问是否镜像中的软件进行了更新？

问题 请问perl正则表达式的捕获中为什么老师只讲了捕获一个变量$1,如果要捕获$2 $3 $4要怎么做？我这样做为什么不行？

问题 老师，在鉴定基因家族成员时，不同物种中已鉴定的此基因家族所用的pfam号是个不相同的，我应该怎么选呢，还是一般都可以用

问题 老师，您好，请问知道登录号的情况下，怎么在EMBL数据库里下载全基因组的表达数据，我想从中提基因家族的表达数据做热图