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问题 t2t基因组,转录组数据注释

...了一组转录组数据,如果有多个不同组织的二代转录组,如何分析?,以及一个混样品的三代转录组数据(用教程Trinity中单独分析代码吗),二代和三代转录组数据如何整合呢? mkdir 18.PASAcd 18.PASAln -s ../14.Repeat/4.RepeatMasker/genome...

文章 神论文!浙大博士写130页论文,教大家怎样挑西瓜....

...大博士已经帮我们算得明明白白了。虽然徒手操作起来还比较困难,但是,此研究有望因此推动中国西瓜对外出口,也是非常利国利民了。一些感悟:“奇葩”论文里面的“题大作”所谓外行看热闹,内行看门道,一个好的研...

文章 cactus下载

...一列是ID,第二列是数据所在路径 后续处理可以参考: 比较基因组学Cactus初探 - 简书

问题 想请教一下一个问题,用R做WGCNA的Module−trait relationships相关性热图时候,按照官网教程,就出来了这样的图,每个格子太了,然后我用普通做热图的命令 cellwidth = , cellheight =,也不能行。请问这个要怎么调整

文章 GGEbioplot分析种质资源在不同环境下的丰产性与稳定性

...相似性。 两环境线段之间的夹角的余弦值是它们的相关系数,夹角于90度表示正相关,说明两环境对品种排序相似,大于90度表示负相关,表示两环境对品种排序相反,等于90度说明两环境不相关。夹角较说明试验点是重复...

文章 项目经理该如何面对频繁的需求变更?

...理解分歧、业务需求改变、项目实现周期长等。 二、如何正确应对研发需求变更 需求变更的控制不应该只是项目实施过程考虑的事情,而是要分布在整个项目生命周期。 为了将项目变更的影响降低到最,我们需要采用...

文章 转录组扫盲系列--转录组如何建库?

...表,做好高级个性化分析发表高分1区不是梦!T2T基因组/比较基因组/泛基因组分析学习链接:T2T基因组组装与注释分析;动植物泛基因组分析 ;比较基因组分析 4. 群体重测序遗传进化分析+GWAS文章,篇篇10+分,缩短分析周期,...

文章 3月23日R语言免费直播课!

....收藏贴-基因/蛋白功能注释、富集分析在线工具详解 3. 如何下载基因组及查找基因 4. CDS、cDNA、ORF等等傻傻分不清 5. qRT-PCR相对定量计算详解 6. 绘一棵超酷炫的系统发育树! 7. 100+篇2019年基因家族分析SCI(1-3月发表)免...

文章 MeV 绘制热图过程如何对图片颜色做出修改

...bow 彩虹色 Custom Color 是用户自行设定颜色 这里简单介绍如何自行设定颜色: 点击Custom Color Scheme进入设置界面: 1、此区域选定渐变类型 double 类型有中间过渡色,single 类型仅没有过度色,这里取double 2、此区域渐变色选定设...

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 数据纠错软件-proovread

...在github 上公开,并不断的更新。 1. 软件的安装 安装方法比较简单,按照官方的说明操作即可。 2. 使用方法 使用也非常的简单,需要设置的输入项比较少,大部分采用默认配置即可。 proovread -t 8 -l isoseq_flnc.fasta -s WT.trim_re...

文章 微生物PCA分析和PCOA分析差别

...CoA分析的矩阵维度与样本数目相关。因此,如果样本数目比较多,而物种数目比较少,那肯定首选PCA;如果样本数目比较少,而物种数目比较多,那肯定首选PCoA。 课程推荐:微生物扩增子分析课程实操     微生物16S/ITS/18S...

文章 VirusDetect-RNA鉴定病毒

...定一些生物是否被病毒侵染,鉴定一些新的病毒。 采用RNA测序鉴定病毒的基本策略主要包括以下3步: 1. 测序数据与宿主基因组进行比对,过滤掉来源于宿主的序列 2. 没有比对上的序列,进行denovo 组装 3. denovo 的序列与已...

文章 ggplot2图例位置legend.position调整

ggplot2绘图过程种,控制图例在图中的位置利用theme(legend.position)参数 该参数对应的设置如下: legend.positionthe position of legends ("none", "left", "right", "bottom", "top", or two-element numeric vector) 其中none 表示隐藏图例,可参考 https://www.o...

问题 生信技能-引物设计课程资料里没有脚本

生信技能-引物设计课程资料里没有脚本

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