...el.fa /home/manager/RNAi/data/work/refs/Oryza_sativa.IRGSP-1.0.dna.toplevel结果发现报错：zsh: segmentation fault hisat2-build -p 8 --ss /home/manager/RNAi//data/work/refs/splicesites.tsv报错请见图片：在这条命令下生成的文件也不全，请见图片：请教老师，这是出...
...eeded p1主要是加了最后一行,的geom_mark_hull这个参数得到的结果如下 其他参数可以看帮助调节
...no_strip_names --cscore 0.8; # 以提升后的anchors作为基因对的结果，把比对上的基因排序去重输出到mapped.txt文件 anchor=pangene.${i}.lifted.anchors; awk '{ print $2}' $anchor | sort -u > ${i}.mapped.txt; # 未能比对上的基因合并到模板里，组...
我用不同的家族基因CDS黏贴到NCBI，发现100%序列的结果是相同的基因，感觉用包含内含子的完整基因序列来设计要好一点。但是发现用包含内含子的完整序列通过NCBIprimerblast来设计引物，发现不能选择跨内含子。不知道哪种方法...
...正在下降，论文数量也是唯一正在减少的国家，这些都在显示，未来的日本情况可能没有现在这么风头正胜了。而我们国家近些年来在科学研究，尤其是基础科研方面，加大了投入也得到了长足的进步，越来越多的原创研究走在...
...pe类型如果同时针对两种分组ID 和type进行，可以获得如下结果： > temp=aggregate(dat[,2:4],by=list(dat$ID,dat$type),FUN=sum)> temp Group.1 Group.2 sample1 sample2 sample31 A 1 1 2 22 C 1 5 5 83 D 1 ...
...据。 1. 直接下载：数据量小于5G的时候适用 ① 检索：搜索一个sra号，进入RUN的详情页 ② 下载到本地：选择download一栏会直接下载到本地，不想下载到本地请看③ ③下载到服务器：复制下载链接到linux上下载 wget -c -b https:/...
...exprSize = checkSets(multiExpr)# 统计样本数量和基因数量 运行结果： > multiExpr=read.csv("5000.csv",header=T,comment.char = "",check.names=F) > datTraits=read.csv("Trait1.csv",row.names=1,header=T,comment.char = "",check.names=F) > allowWGCNAThreads() Allowing multi-threadi...
...也是最重要的一步，其他所有分析内容都是基于reads比对结果分析的，如下图： 那么，reads比对是你所想的那样，根据序列互补直接比到参考基因上吗？事实上，reads比对没那么简单，应为真核生物的基因组结构复杂，外显子...
...基因家族分析 3. 转录组越做越普遍，实验必备，看不懂结果？不会深入分析？自学都可以搞定，学习链接：有参转录组自主分析实操 ；转录组与代谢组结果解读/个性化数据分析 ； 4. 代谢组分析硬件要求不高，个人电脑就...
...-g subtype.hclust \ --celltype "B cells" "T cells" -o immu -n ssgse 结果：
...能发基因家族文章吗，答案是肯定可以的，刚刚到pubmed上搜索了一下，发的文章还是挺多的： 基因家族分析作为低投入高产出的发文思路，受到广泛关注，分析的人也越来越多，我们也对基因家族分析课程针对之前学员经常...
... 6/10 = 0.60chr2 2500 9/10 = 0.90 创建 BED 文件 将计算结果保存为 BED 文件 methylation.bed： chr1 1000 1001 0.50chr1 2000 2001 0.50chr1 3000 3001 0.80chr2 1500 1501 0.60chr2 2500 2501 0.90 使用...
...scripts/geo_gene_exp_download.r -g GSE12417 -o GSE12417-array --skip 27 结果如下：