前不久Nature曾经发布过一个文章， 文章显示，在针对6300名博士的调查中, 有1/4的博士表示，如果再给一次机会，他们想重新选导师...... 有49%的博士表示：他们每周与导师面对面时间不到一小时，平均1天交流不到9分钟...... ...
命令如上，产生其中一个（T01)结果如下：找不到我所期待的基因，这是什么原因呀
...ributionNotFound(req) pkg_resources.DistributionNotFound: pysam 网上也搜索了报错信息，还是不明白，不知道怎么解决。
...11 hm24h18 GSM1626012 hm24h 按照第二列分类进行数据分组，由结果可知被划分成了六组数据 > com = split(dat,dat$group)> com$con12h Samples group4 GSM1625998 con12h5 GSM1625999 con12h6 GSM1626000 con12h$con24h Samples group7 GSM1626001 con24h8 GSM1626002 con...
..."Tumor",'Normal')) p + stat_compare_means(comparisons = my_comparisons) 结果如下下图： 如果您想学习TCGA数据挖掘方法，可以学习我的课程： 《TCGA-生存分析》 《TCGA-基因差异表达分析》 《TCGA-转录因子调控》 《TCGA-ceRNA调控网络分析...
...没错，就是那种——平时不露面不管你，一露面就催你出结果的那种。。。。 真是一言难尽。。。 学霸姐姐就曾经听到了某位学弟的吐槽：他的导师半年多没有去实验室了，几位师兄师弟穷得都快用不起实验耗材了。。。 想...
...顺序要与layout中基因组顺序一致。 最后就可以画图了，结果如图所示：
...，例如MaxQuant 对数据进行处理。最终得到样本中的蛋白质结果及其表达量信息； 2. 不同生物样本之间蛋白质表达量的差异分析 通过R脚本对蛋白质表达量数据进行差异分析，得到具有显著差异的蛋白质数据集。同时绘制火山...
...地址分别为SRR，SRR+前三个数、SRR号、SSR号.sra 得到如下结果： 最后，将链接粘贴到迅雷下载即可， 是不是很方便？ Tips: 如果下载上百个样品，手动粘贴就太累了。在Linux下可以实现一键自动产生下载链接，输入文件...
...进行过滤，并试验了使用nohup和不使用nohup后得到的文件结果比较，使用nohup得到的vcf文件结果有异常不能进行后续分析，具体如下： 1）不使用nohup时的代码 vcftools --gzvcf rice.raw.vcf.gz --recode --recode-INFO-all \ --stdout --maf 0.05 --max-...
...异。在 GWAS 中，通常假设与 HWE 的差异是基因分型错误的结果。病例中的 HWE 阈值通常不如对照组中的阈值严格，因为在病例中违反HWE法则可表明。GWAS关联分析课程推荐：https://study.163.com/course/introduction/1212364803.htm?share=1&shareId...
...(T1D) 和溃疡性结肠炎 (UC)。作者使用这些数据的GWAS的关联结果，利用cFDR的方法发现这些疾病关联的多效基因。QQ图展示多效富集 分别绘制以10 种自身免疫性疾病为主要性状，ALS为条件性状的条件分层QQ图，发现曲线随着与条件...
...PCLR分析：https://www.omicsclass.com/article/1334#python 版本的xpclr,结果说明见： https://github.com/hardingnj/xpclrfor i in Chr1 Chr2 Chr3 Chr4 Chr5 Chr6 Chr7;do #不同的染色体分别计算 xpclr --format vcf --input $workdir/00.filter/clean.vcf.gz \ --sample...
...并非是一个单一的工具，而是通过整合多个LTR预测软件的结果，过滤其中的假阳性LTR-RT，得到高质量的LTR-RT库，因此需要配合LTRharvest, LTR_FINDER, MGEScan 3.0.0等软件使用。其中LTRharvest软件运行耗时很长，而用LTR_HARVEST_parallel则可以...
...户不太注意的点上进行“微创新”。比如操作进行优化，显示更加人性化等等。 凭着“工匠精神”召唤，以及罗永浩巧舌如簧的宣传，锤子手机一经出世便受到了广泛的关注。 可惜的是，罗永浩的项目管理能力并不如...