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文章 蛋白结构预测

...步骤来预测蛋白质结构: 线程: I-TASSER首先使用线程技术搜索已知蛋白质结构的数据库,找到与目标蛋白质序列相似的模板。这一步是基于蛋白质结构更为保守的原理。结构装配: 使用模板匹配的片段构建蛋白质的初步三维结构...

文章 【前沿研究】肺癌转移机制的新靶点-- lncRNA AC026904.1

...然后,研究者研究了AC026904.1是否受TGF-β/Smad信号的调控。结果表明,TGF-β受体激酶的特异性抑制剂的预处理对TGFβ诱导的AC026904.1上调没有影响,这表明AC026904.1不是TGFβ/Smad信号的下游效应器。为了进一步确定TGF-β提高AC026904.1表达...

问题 泛基因集执行命令时,由syn.txt文件到最后output.txt和final.last.gene.pair.txt文件生成时会丢失一些基因吗?我做自己的物种分析时发现丢失了一些基因,是什么原因?这正常吗

...se{if($0 in val) print $0}}' syn.txt - > output.txt wc -l output.txt  #显示文件含有的基因数  #第三段命令 # 匹配位置信息 awk 'NR==FNR{a[$4]=$0;next}NR>FNR{if($2 in a)print a[$2]}' all.bed output.txt \  | awk '{ print $1"\t"$2"\t"$3}' | sed "s/_/\t/g" | paste output.txt -...

文章 肿瘤的TNM分期讲解(stage)

...据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读;转录组(无参)结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分...

文章 如何利用NCBI提取特定位置的基因组序列?

...泛基因家族分析3. 转录组越做越普遍,实验必备,看不懂结果?不会深入分析?自学都可以搞定,学习链接:有参转录组自主分析实操 ;转录组与代谢组结果解读/个性化数据分析 ; 4. 代谢组分析硬件要求不高,个人电脑就...

文章 简单科普:2019诺贝尔生理学或医学奖为啥颁给“细胞感受氧气”?

..., because you declare victory and get lazy.” ——科学中最危险的结果就是你所希望的结果,因为你会宣布胜利并变得懒惰。 大佬们永远不会止步于当前的胜利,也不会就此停住脚步,他们都在致力于研究可能的癌症治疗方法。 尽管...

问题 isoseq3 cluster 跑不出unpolished.bam

...三步都整成输出,但是做第四步时,一直运行,且得不到结果,本地日志文件也没有报错信息,cluster.log没有信息。 1.ccs m062922.subreads.bam movie.ccs.bam --noPolish --minPasses 1 -j 24 2.lima movie.ccs.bam primers.fasta movie.fl.bam --isoseq --no-pbi -j 24 ...

文章 植物学家奇思妙想-改造基因组培育辣味番茄!

...辣椒素积累是个动态过程,是合成和降解两过程综合作用结果,而且,辣椒素的合成与降解能力又与遗传、环境有关,作者细数了诸如水分、温度、光照、伤害、营养元素等环境因子对辣椒素积累的影响,如下图: 辣椒素含有...

问题 各位老师好,无参转录组中挑出来的一段序列应该怎么进行后续的实验

我现在研究的昆虫在NCBI上还没有完整的基因组,搜索我所研究的昆虫也几乎没有什么基因,但是同一个目 的昆虫有比较深入的研究了。这是前提。正在着手测基因组,但前期测了一个无参的转录组,从中挑选并得到一段序列,...

文章 SMB1.0客户端导致的网络驱动器(群辉NAS存储)上的文件无法打开查看编辑等问题(win10)

登陆网络共享存储,找到预处理的文件,结果发现文件打不开,无法编辑,甚至拷贝都出现权限受限问题。但是查看整个权限设置一点问题都没有~~~why? 切换到其他电脑上进行登陆,又没有这个问题了————可能是PC端...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BLCA膀胱癌(GSE192575)

...an_Res.tar.gz tar zxvf GSM5751918_human_Sen.tar.gz 运行完以上代码结果目录如下: 单细胞分析代码: 这里是标准的10X的数据,所以用--data.dir参数直接读入数据: #读入数据1 Rscript $scripts/seurat_sc_qc.r --data.dir human_Res --project BLCA_GSE192...

文章 已知目标基因,如何进行局部共线性绘图?

...好将要绘制的染色体在画布上的布局,然后再根据绘制的结果对布局文件进行相应的调整。如果大家觉得这里比较难以理解,不妨对照着后面的绘图结果进行梳理。 绘图流程 我们所说的局部共线性,也就是目标基因所在的染...

文章 Win11怎么关闭Hyper-V?关闭Hyper-V的2种方法

...闭Hyper-V方法一: 首先,同时按【win+s】快捷键快速打开搜索,输入cmd或者power shell 并右键点击以管理原身份运行, 在此窗口粘贴以下命令并回车就可以禁用Hyper-V了: dism.exe / Online / Disable-Feature / FeatureName: Microsoft-Hyper-V-All ...

文章 SCI文章投稿各阶段的电子邮件模板合集

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问题 诱变材料,且已自交 6 代,是否可用 QTL-seq 的方法来定位到基因?

我在网上搜索的关于 QTL-seq 的原理。为什么诱变得到的材料不能够用 QTL-seq 的方法来定位到基因?如果是 EMS 诱变材料且已自交 6 代,也不能采取 QTL-seq 的方法来定位到基因么?为什么?因为 Mutmap 方法需要野生型和突变型杂...