... 基本原理：在生理状态下把细胞内的DNA与蛋白质交联在一起，通过超声或酶处理将染色质切为小片段后，利用抗原抗体的特异性识别反应，将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来。染色质免疫沉淀技术一般包括细胞固定、染色...
...体结构校正了，请问出现这种情况可能的原因是什么，该怎么解决。另外，我看到一种方法叫Genomic control可以用膨胀系数对P值进行校正，但这是对结果的校正，有分析的准确性有多大意义呢？还请不吝赐教，万分感谢！
... 如前所述,tensorQTL是做xqtl 的,这里介绍命令行用法,分析是怎么做的 计算顺式 QTL 分析中的 nomial p-value (名义 p 值) 这是最常见的xQTL 的cis结果的分析,使用的mode为cis_nominal 命令为 python3 -m tensorqtl \ Genotype \ # Genotype...
...接受了6个周期的CHOP（环磷酰胺，多柔比星，长春新碱）和高剂量的甲氨蝶呤治疗，疾病得到有效控制。但是，不幸的是，三年后他又被确诊患有慢性粒细胞白血病（CML），更不幸的是，在2014年他的NKTL肿瘤又复发，最后，由于...
...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl、R语言画图，更多免费课程请点击以下链接： htt...
...有时候数据下载不了 -i 提供私钥文件的地址，免密从SRA和ENA下载，不能少，地址一般是:/share/work/biosoft/aspera/latest/cli/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 设置最大传输速度，一般200m到500m，如果不设置，反而速度会比较低，可能有个较低的...
1.我的数据介绍： 我这做了 一个对照和处理各取了四个时期的样品进行转录组分析，每个样品3个生物学重复，共24个样品基因表达量数据； stage1stage2stage3stage4controlDAF2 DAF5DAF11DAF16caseGDAF2 GDAF5GDAF11GDAF16 以上是输入数据，CK...
...用课程中的R语言脚本画图时，提示报错如下 Error in `[.data.frame`(metadata, , opt$cor_name) : 选择了未定义的列 Calls: print ... scales_add_defaults -> lapply -> FUN -> [ -> [.data.frame 我的数据为两列污染数据，类似： 已转为tsv格式 源代...
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCA_007927625.1
...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读
...定及整理 以下为鉴定细胞器基因组的SSR、串联重复序列和散在重复序列的教程 SSR：https://www.omicsclass.com/article/1977 Tandem repeats：https://www.omicsclass.com/article/2363 Dispersed repeats：https://www.omicsclass.com/article/2298 将SSR、串联重复序...
...据中下载的基因组文件（Oryza_sativa.IRGSP-1.0.dna.toplevel.fa）和基因组注释文件（Oryza_sativa.IRGSP-1.0.46.gff3），然后利用命令：gffread Oryza_sativa.IRGSP-1.0.46.gff3 -T -o Oryza_sativa.gtf将gff文件生成的gtf。然后按照课程步骤进行分析，按照课程一...
在read.table读取文件时出现了行名重复的情况，会导致报错： 文件内容： 报错信息： 此时需要对重复的行名进行重命名处理，方法一： 先不读取行名，使用make.names函数给行命名： d<-read.table("test.xls", header = T, check.names = ...
...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. NCBI数据上传
就是这些步骤完成之后如何可视化，https://www.omicsclass.com/article/558