问题 老师好，我想请问一下在绘制基因家族 exon–intron structure 时如果参考基因组GFF文件里没有exon和UTR信息，只有mRNA和CDS的话怎么办呢？

问题 老师您好，我在进行megahit组装后运行quast.py这段出现报错，查看megahit.log文件后，出现的最后一行command的信息为Exit code -15,请问这是怎么回事呢？

文章 Linux 统计目录下文件数量的方法

... 3 个命令做个介绍。 1、ls -l 长列表输出该目录下文件信息(注意这里的文件是指目录、链接、设备文件等)，每一行对应一个文件或目录，ls -lR 是列出所有文件，包括子目录。 2、grep “^-” 过滤ls的输出信息，只保留一般文件...

文章 植物科学常用数据库和生物信息学工具

...基因库下属数据库，涵盖各种生物的全面公开可用的数据信息 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 美国国家生物技术信息中心的生物医学和基因组信息门户网站 https://www.oxfordjournals.org/nar/database/cat/13  牛津大学出版社提供的植物科学相关...

问题 请老师帮忙看看为啥一样的操作，将anchors.simple更新了基因家族的数据进去就做不出来图了，不添加基因家族信息可以作图，而且名字改了 对应的mcsacn.layout 也改了

文章 企业如何选择适合自己的项目管理软件?

...了解都有哪些独到之处！ 一、简洁的项目任务分配与信息全面的甘特图         管理项目在CORNERSTONE中非常的简单，任务里程碑可以清晰表现每个任务的时间期限；任务列表可以编辑与查看任务具体信息；通过看板功能...

文章 4个样品重测序发PlosOne

...得到测序reads与参考基因组比对，查找SNP，Indel，SV等变异信息，并对变异信息进行质控过滤，变异信息在染色体上的分布比较，统计信息；这些都是常规重测序变异检测分析内容； 重要的分析内容, 也是文章的亮点在于，作...

问题 基因家族分析,提取一个物种信息后，再次取提取另一物种cds 用基因的ID，作为序列的ID，总是无法运行，显示脚本不存在，但是LL查看脚本是存在的。

Can't open per1 script ''/work/gene_family/scripts//get_gene_longest_fa.p1'':No such file or directory

文章 VennDiagram各区域信息提取

...n.plot) 之后基于相关代码调整即可。 2 如何获取各区域信息是绘制Venn图的一个关键问题 可以基于VennDiagram提供的计算函数 calculate.overlap 或者get.venn.partitions 以前者为例： area=calculate.overlap(xList)> typeof(area)[1] "list"> sum...

问题 你好老师，我想请问一下，有没有代码可以计算群体的多态性信息含量PIC值，观察等位基因数A，有效等位基因数Ae啊，ddRAD测序做的分析有限，想增加点分析

比如文献里计算的这些

文章 perl自动获取网页上的信息

perl自动上网，然后获取网页上的信息： #!/usr/bin/perl -w# Perl pragma to restrict unsafe constructs use strict; # use LWP::UserAgent model use LWP::UserAgent; # main function sub main {     # get params    # @_      # Within a subroutine the array @_ contains the param...

问题 您好 请问我目前有一个miRNA的靶基因预测及GO分析和KEGG分析注释表格信息 可以做网络图吗 我在网络课堂里看到的演示和我的还是不完全一样 有一些疑问

问题 老师好，我想问一下为什么这两个步骤结果对不上，第一个结果里面没有cds的信息。基因文件是在ncbi上下的，步骤也都是按照视频来的。第一次弄不太懂

文章 利用qiime2对微生物扩增子测序数据文库根据barcode信息拆分数据

首先准备sample-metadata.tsv文件，样本的barcode 文件信息，这里以双端测序为例： sample-id       forward-barcodes        reverse-barcodesLin027  GATCTGCA        CTACGATGLin028  GATCTGCA        GACATAGCLin029  GATCTGCA        GATCTGCALin032  GATCTGCA  ...

文章 生命大数据

...带来20余先锋议题，将为大会带来哪些新的看点？ 会议信息｜BT与IT融合   会议名称：第三届基因组云计算技术开发者大会（GCTA 2018） 发起方：广东省生物信息学会、深圳市生物信息云计算产业促进会、深圳基因产学研资...